Análisis computacional asociado al genoma de una levadura aislada en Colombia con potencial biotecnológico para producir polialcoholes
<p>Los polialcoholes son una alternativa para sustituir el azúcar como edulcorantes. Estos compuestos son formas reducidas de azúcares e incluyen glicerol y polioles de cadena más larga como eritritol, ribitol, xilitol, arabitol, sorbitol y manitol. Han ganado interés comercial como sustituto del azúcar por parte de la industria alimentaria. Dentro de este grupo de polialcoholes, el xilitol resulta interesante por su bajo valor calórico en comparación con los demás polialcoholes, pero con el mismo dulzor que la sacarosa. La producción industrial de xilitol involucra la hidrogenación química de una solución de xilosa pura, este proceso se lleva a cabo a alta temperatura y presión usando níquel como catalizador metálico y su producción es costosa y consumidora de energía, mientras que la producción microbiana está ganando popularidad como una alternativa sostenible que elimina la necesidad de sustrato de xilosa pura. La conversión microbiológica de xilosa a xilitol ofrece una alternativa posiblemente mejor en términos de energía y costos de proceso. Las levaduras, particularmente las del género Candida sp., pueden convertir la xilosa en xilitol como fuente de carbono. Recientemente, se han investigado varias estrategias de ingeniería metabólica para cambiar enzimas clave para mejorar la producción de xilitol. En este estudio se secuenció el genoma de la levadura Candida tropicalis cepa IBUN-090-03567 aislada en territorio colombiano, que posee notables capacidades en el consumo de pentosas y la generación de xilitol. Se utilizaron algunos ensambladores y se realizó un proceso de pulido. Posteriormente, se realizó el proceso de andamiaje con diferentes herramientas. Se realizaron comparaciones genómicas utilizando la herramienta D-genies frente a diferentes genomas de C. tropicalis. El mejor ensamblador obtuvo 7 andamios 2.857.244 pb para el andamio más largo, 14.823.484 pb para el tamaño total del genoma, 33,48% para el porcentaje de GC y el valor N50 fue 2.516.154. Este conocimiento nos permite comprender mejor las reacciones y los procesos necesarios para su crecimiento, así como evaluar las estrategias metabólicas que emplea para crear sustancias químicas de importancia industrial como el xilitol.</p>
ShareScore
32/100
Overall dataset sharing score
Score breakdown
These five areas show where the dataset supports — or may limit — practical reuse.
- Stewardship
- 4
- Harmonization
- 4
- Access
- 16
- Reuse readiness
- 8
- Engagement
- 0