Find research datasets worth reusing
Search datasets from major research repositories and use ShareScore to quickly assess how well each record supports discovery, access, and reuse.
468
datasets available to search
ShareScore release 0.9.0
Dataset results
468 results for “MERS”
FIG. 2 in Entre tradition classique et imaginaire germano-celtique: les monstres anthropomorphes des mers septentrionales, au Moyen Âge et au début de l'époque moderne
FIG. 2. — Gladius. Westminster Abbey Bestiary, York,c. 1270-1290. (Abbaye de Westminster, Bibl., 22, f. 44). © Dean and Chapter of Westminster.
FIG. 1 in Entre tradition classique et imaginaire germano-celtique: les monstres anthropomorphes des mers septentrionales, au Moyen Âge et au début de l'époque moderne
FIG. 1. — Serra (au-dessus) et Gladius (en-dessous). Brunet Latin, Le livre du Trésor. France,c. 1310-1320 (Saint Petersbourg,B.N., fr. f.v.III,4, f. 45v). D'après Heck & Cordonnier 2011: 536.
FIG. 8 in Entre tradition classique et imaginaire germano-celtique: les monstres anthropomorphes des mers septentrionales, au Moyen Âge et au début de l'époque moderne
FIG. 8. — Episcopus marinus. Sluperius, Omnium fere gentium, nostraeque aetatis nationum, habitus et effigies, et in eosdem epigrammata. Anvers, 1572: 47, 48. (cliché Rémy Cordonnier, BASO, Saint-Omer).
FIG. 4 in Le morse et le phoque dans les mers du Nord au Moyen Âge: chasse, exploitation, commerce. Une approche par les textes
FIG. 4. — Autel portatif en ivoire de morse (Angleterre ou France septentrionale, XIIe siècle). Photo Benoît Roland, Musée Antoine Vivenel, Compiègne.
FIG. 3 in Le morse et le phoque dans les mers du Nord au Moyen Âge: chasse, exploitation, commerce. Une approche par les textes
FIG. 3. — Pièce d'échecs (tour) en ivoire de morse (Angleterre, France ou Scandinavie, milieu XIIIe siècle). Photo Benoît Roland, Musée Antoine Vivenel, Compiègne.
FIG. 1 in Le morse et le phoque dans les mers du Nord au Moyen Âge: chasse, exploitation, commerce. Une approche par les textes
FIG. 1. — -Localisation des Norðrsetr et des sites archéologiques en rapport avec le morse et/ou le phoque.
FIG. 11. — Stigmates d in Des exploitations intensives d'huîtres pendant l'Antiquité et le Moyen Âge sur le littoral atlantique français: l'exemple de Beauvoir-sur-Mer (Vendée)
FIG. 11. — Stigmates d'ouverture sur la face interne d'huîtres trouvées jointives: A, L=92 mm; B, L=120 mm; C, L=107 mm (C. Dupont, CNRS).
FIG. 10. — Localisation des stigmates d in Des exploitations intensives d'huîtres pendant l'Antiquité et le Moyen Âge sur le littoral atlantique français: l'exemple de Beauvoir-sur-Mer (Vendée)
FIG. 10. — Localisation des stigmates d'ouverture observés à Beauvoir-sur-Mer. Abréviation: N, nombre de valves étudiées (C. Dupont, CNRS).
FIG. 9. — Distribution des stigmates d in Des exploitations intensives d'huîtres pendant l'Antiquité et le Moyen Âge sur le littoral atlantique français: l'exemple de Beauvoir-sur-Mer (Vendée)
FIG. 9. — Distribution des stigmates d'ouverture d'huîtres observés sur les huîtres de Beauvoir-sur-Mer. Abréviation: N, nombre de valves étudiées (C. Dupont, CNRS).
FIG. 8 in Des exploitations intensives d'huîtres pendant l'Antiquité et le Moyen Âge sur le littoral atlantique français: l'exemple de Beauvoir-sur-Mer (Vendée)
FIG. 8. — Typologie des stigmates liés à l'ouverture des huîtres: 1, absence de stigmate; 2, impact sous forme d'esquille circulaire ou allongé sans cassure du bord coquillier; 3, échancrure pointue; 4, encoche de largeur égale ou supérieure à 5 mm; 5, cassure rectiligne du bord coquillier; 6, encoche de largeur inférieure à 5 mm plus profonde que large; 7, encoche de largeur inférieure à 5 mm plus large que profonde (l'orientation des stigmates est arbitraire sur cette figure). Échelle: 1 cm (C. Dupont & L. Quesnel, CNRS).
FIG. 7. — Exemples d in Des exploitations intensives d'huîtres pendant l'Antiquité et le Moyen Âge sur le littoral atlantique français: l'exemple de Beauvoir-sur-Mer (Vendée)
FIG. 7. — Exemples d'outils potentiellement utilisés pour exploiter les huîtres (C. Dupont & L. Quesnel, CNRS).
FIG. 6 in Des exploitations intensives d'huîtres pendant l'Antiquité et le Moyen Âge sur le littoral atlantique français: l'exemple de Beauvoir-sur-Mer (Vendée)
FIG. 6. — Mesure de la plus grande dimension des perforations en fonction de la forme du stigmate. Abréviation: N, nombre de valves étudiées (C. Dupont, CNRS).
FIG. 2 in Des exploitations intensives d'huîtres pendant l'Antiquité et le Moyen Âge sur le littoral atlantique français: l'exemple de Beauvoir-sur-Mer (Vendée)
FIG. 2. — Localisation des dépôts coquilliers mentionnés dans le texte, d'après Verger 2005 (L. Quesnel, CNRS).
K-mer databases of plant virus sequences for use with the Kodoja workflow
<p><strong>Details</strong></p> <p>This is a gzipped tar file that includes the plant virus database files required to run the Kodoja workflow (https://github.com/abaizan/kodoja)[1]. Kodoja is a workflow for the detection of plant virus sequences in RNA-seq data files that uses two previoulsy published tools Kraken[2] and Kaiju[3].</p> <p>This file contains databases for Kraken [2] and Kaiju [3]. The file includes the kraken database files: database.idx, database.kdb, nodes.dmp, names.dmp and the kaiju database file kaij_library.fmi.</p> <p>These k-mer databases are based on virus sequences in RefSeq [4] (ttps://www.ncbi.nlm.nih.gov/refseq/) with plant hosts as defined in the Virus-Host Database [5] (https://www.genome.jp/virushostdb/).</p> <p><strong>Version</strong><strong> 1.0</strong></p> <p>kodojaDB_v1.0 is based on RefSeq v89 and the Virus-Host Database (accessed 03/09/2018 which is based on RefSeq 89 and Genbank 226.0). The viral partition of RefSeq v89 genome comprises 7946 viruses (ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/genomes/refseq/viral/assembly_summary.txt).</p> <p>kodojaDB_v1.0 was created using kodoja_retrieve.py which is part of the kodoja workflow (v0.05) (https://github.com/abaizan/kodoja).</p> <p><strong>References</strong></p> <p>[1] Baizan-Edge, A, Cock, P, MacFarlane, S, McGavin, W, Torrance, T, Jones, S. Kodoja: A workflow for virus detection in plants using k-mer analysis of RNA-sequencing data (under review Nucleic Acids Research). </p> <p>[2] Wood,D.E. and Salzberg,S.L. (2014) Kraken: ultrafast metagenomic sequence classification using exact alignments. <em>Genome Biol.</em>, <strong>15</strong>, R46</p> <p>[3] Menzel,P., Ng,K.L. and Krogh,A. (2016) Fast and sensitive taxonomic classification for metagenomics with Kaiju. <em>Nat. Commun.</em>, <strong>7</strong>, 1–9.</p> <p>[4] O’Leary,N.A., Wright,M.W., Brister,J.R., Ciufo,S., Haddad,D., McVeigh,R., Rajput,B., Robbertse,B., Smith-White,B., Ako-Adjei,D., <em>et al.</em> (2016) Reference sequence (RefSeq) database at NCBI: Current status, taxonomic expansion, and functional annotation. <em>Nucleic Acids Res.</em>, <strong>44</strong>, D733–D745.</p> <p>[5] Mihara,T., Nishimura,Y., Shimizu,Y., Nishiyama,H., Yoshikawa,G., Uehara,H., Hingamp,P., Goto,S. and Ogata,H. (2016) Linking virus genomes with host taxonomy. <em>Viruses</em>, <strong>8</strong>, 10–15</p>
Linked collectors and determiners for: Bibliographie de la faune, la flore et la fonge de France métropolitaine et outre-mer - L'Amateur de Papillons.
Natural history specimen data linked to collectors and determiners held within, "Bibliographie de la faune, la flore et la fonge de France métropolitaine et outre-mer - L'Amateur de Papillons". Claims or attributions were made on Bionomia by volunteer Scribes, <a href="https://bionomia.net/dataset/3b8dc184-ab49-4eeb-b3eb-ee5dc858f2f0">https://bionomia.net/dataset/3b8dc184-ab49-4eeb-b3eb-ee5dc858f2f0</a> using specimen data from the dataset aggregated by the Global Biodiversity Information Facility, <a href="https://gbif.org/dataset/3b8dc184-ab49-4eeb-b3eb-ee5dc858f2f0">https://gbif.org/dataset/3b8dc184-ab49-4eeb-b3eb-ee5dc858f2f0</a>. Formatted as a Frictionless Data package.
Linked collectors and determiners for: Bibliographie de la faune, la flore et la fonge de France métropolitaine et outre-mer - Bibliographique de la faune, la flore et la fonge de France métropolitaine et outre-mer.
Natural history specimen data linked to collectors and determiners held within, "Bibliographie de la faune, la flore et la fonge de France métropolitaine et outre-mer - Bibliographique de la faune, la flore et la fonge de France métropolitaine et outre-mer". Claims or attributions were made on Bionomia by volunteer Scribes, <a href="https://bionomia.net/dataset/d18935d7-260c-4633-af39-7eb7ee6f1e14">https://bionomia.net/dataset/d18935d7-260c-4633-af39-7eb7ee6f1e14</a> using specimen data from the dataset aggregated by the Global Biodiversity Information Facility, <a href="https://gbif.org/dataset/d18935d7-260c-4633-af39-7eb7ee6f1e14">https://gbif.org/dataset/d18935d7-260c-4633-af39-7eb7ee6f1e14</a>. Formatted as a Frictionless Data package.
Linked collectors and determiners for: Bibliographie de la faune, la flore et la fonge de France métropolitaine et outre-mer - R.A.R.E. Revue de l'Association Roussillonnaise d'Entomologie.
Natural history specimen data linked to collectors and determiners held within, "Bibliographie de la faune, la flore et la fonge de France métropolitaine et outre-mer - R.A.R.E. Revue de l'Association Roussillonnaise d'Entomologie". Claims or attributions were made on Bionomia by volunteer Scribes, <a href="https://bionomia.net/dataset/ad2898c2-a82e-46f2-9e6e-e3872d728dcc">https://bionomia.net/dataset/ad2898c2-a82e-46f2-9e6e-e3872d728dcc</a> using specimen data from the dataset aggregated by the Global Biodiversity Information Facility, <a href="https://gbif.org/dataset/ad2898c2-a82e-46f2-9e6e-e3872d728dcc">https://gbif.org/dataset/ad2898c2-a82e-46f2-9e6e-e3872d728dcc</a>. Formatted as a Frictionless Data package.
Linked collectors and determiners for: Bibliographie de la faune, la flore et la fonge de France métropolitaine et outre-mer - Bulletin mensuel de la société linnéenne de Lyon [1932- ].
Natural history specimen data linked to collectors and determiners held within, "Bibliographie de la faune, la flore et la fonge de France métropolitaine et outre-mer - Bulletin mensuel de la société linnéenne de Lyon [1932- ]". Claims or attributions were made on Bionomia by volunteer Scribes, <a href="https://bionomia.net/dataset/0001480b-76ca-4f30-86bc-f4292481554b">https://bionomia.net/dataset/0001480b-76ca-4f30-86bc-f4292481554b</a> using specimen data from the dataset aggregated by the Global Biodiversity Information Facility, <a href="https://gbif.org/dataset/0001480b-76ca-4f30-86bc-f4292481554b">https://gbif.org/dataset/0001480b-76ca-4f30-86bc-f4292481554b</a>. Formatted as a Frictionless Data package.
Linked collectors and determiners for: Bibliographie de la faune, la flore et la fonge de France métropolitaine et outre-mer - Bulletin de la société entomologique de France [1896- ].
Natural history specimen data linked to collectors and determiners held within, "Bibliographie de la faune, la flore et la fonge de France métropolitaine et outre-mer - Bulletin de la société entomologique de France [1896- ]". Claims or attributions were made on Bionomia by volunteer Scribes, <a href="https://bionomia.net/dataset/ad4d7478-1789-4291-955c-b30cc889365b">https://bionomia.net/dataset/ad4d7478-1789-4291-955c-b30cc889365b</a> using specimen data from the dataset aggregated by the Global Biodiversity Information Facility, <a href="https://gbif.org/dataset/ad4d7478-1789-4291-955c-b30cc889365b">https://gbif.org/dataset/ad4d7478-1789-4291-955c-b30cc889365b</a>. Formatted as a Frictionless Data package.
FIG. 4. — Neoglyphea neocaledonica n in Découverte en mer du Corail d'une deuxième espèce de glyphéide (Crustacea, Decapoda, Glypheoidea)
FIG. 4. — Neoglyphea neocaledonica n. sp., holotype: A, vue latérale de la partie du corps en avant du sillon cervical; B, céphalothorax en vue latérale montrant la disposition des sillons. Abréviations: a, sillon antennaire; b.c., sillon branchiocardiaque; c, sillon cervical; h1, h2, sillons hépatiques; i, sillon inférieur; p.c., sillon post-cervical. Échelle: 5 mm.
ScienceDex guides
Understand access before you commit
These curated guides explain access requirements, typical timelines, costs, and reuse considerations for widely used research datasets.
Allen Brain Atlas
Allen Brain Atlas is an Allen Institute collection of brain map atlases, datasets, APIs, and analysis tools covering mouse, human, and non-human primate brain resources.
Annotated Behaviour and Observability Dataset (ABODe)
ABODe is a University of Edinburgh DataShare dataset for behavior classification in group-housed mice using home-cage video, identities, bounding boxes, ground-plate positions, and annotator labels.
DANDI Archive for NWB datasets
DANDI is a BRAIN Initiative archive for publishing and sharing neurophysiology data, including electrophysiology, optophysiology, and behavioral data packaged as NWB and related standards.
International Brain Laboratory public data
The International Brain Laboratory public data releases expose standardized mouse decision-making experiments, including Neuropixels recordings, widefield calcium imaging, behavior, and session metadata accessed through the ONE API.
OpenNeuro
OpenNeuro is a free, open platform for sharing neuroimaging datasets, with public search, dataset pages, and download paths for web, S3, DataLad, and the OpenNeuro CLI.