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On-Glacier Meteorological Data for Haut Glacier d'Arolla, Switzerland
<p>The compiled dataset is a series of summer meteorological observations on the Swiss Haut Glacier d'Arolla (45.97°N, 7.52°E) <br>to support the analysis presented in the manuscript:</p><p>%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%<br> "The Decaying Near-Surface Boundary Layer of a Retreating Alpine Glacier", <br>submitted to Geophysical Research Letters. </p><p>Thomas E. Shaw1, Pascal Buri1, Michael McCarthy1, Evan S. Miles1, Álvaro Ayala2, Francesca Pellicciotti1</p><p>1 Swiss Federal Institute, WSL, Birmensdorf, Switzerland<br>2 Centro de Estudios Avanzados en Zonas Áridas, La Serena, Chile</p><p>%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%</p><p>The following files are provided:<br>1) 6 x xlsx files "Arolla_Meteorological_Data_[YEAR].xlsx"<br> contains within are tabs for:<br> i) The station locations and elevations (tab "[YEAR]_Info").<br> ii) All AWS/Tlogger data in hourly format (tab "[YEAR]_Met_Data").<br> iii) Only the hourly air temperature data for on-glacier sites (tab "[YEAR]_Ta").</p><p>2) Glacier outlines (.shp) for years 1850 (GLAMOS), 1973 (GLAMOS), 1994 (Carenzo, 2012), 1999 (Carenzo et al., 2012), 2010 (GLAMOS), 2022 (Digitised from PlanetScope imagery).<br>3) Debris cover area (.shp) derived by applying an NDSI classification of cloud filtered, summer Landsat scenes in Google Earth Engine following the approach of Scherler et al. (2018).</p><p>For the meteorological data in 1), the following variables are provided:<br>"TA" = near surface air temperature (°C).<br>"RH" - relative humidity (%).<br>"SWIN" - Shortwave incoming radiation (Wm^-2).<br>"SWOUT" - Shortwave outgoing radiation (Wm^-2).<br>"LWIN" - Longwave incoming radiation (Wm^-2).<br>"LWOUT" - Longwave outgoing radiation (Wm^-2).<br>"FF" - Wind speed (m s-1).<br>"DIR" - Wind direction (°).<br>"PP" - precipitation (mm).<br>"DEW" - dew point temperature (°C).</p><p>The term "OG" refers to an off-glacier station, which are numbered accordingly. If no variable names are given as a header in the "Met_Data" tab, then the data are air temperature values. </p><p>Data are filtered for obvious errors and errors are then removed. Data are not gap-filled as this would affect the analysis presented about patterns in air temperature data. </p><p>Data were checked and compiled by Thomas Shaw (WSL) - thomas.shaw@wsl.ch<br>Data were measured by ETH (2001-2010) and WSL as part of the Marie-Curie Project 'TEMPEST' (2021-2022).</p><p>Details of data collection and analysis can be found in:<br>Strasser et al. (2004) - 2001.<br>Carenzo (2012) - 2001-2010.<br>Shaw et al. (N.D.) 2021-2022. </p><p>%% CITED WORK</p><p>Carenzo, M. (2012). Distributed modelling of changes in glacier mass balance and runoff (Issue 20616). ETH Zurich.</p><p>Scherler, D., Wulf, H., & Gorelick, N. (2018). Global Assessment of Supraglacial Debris-Cover Extents. Geophysical Research Letters, 45(21), 11,798-11,805. https://doi.org/10.1029/2018GL080158</p><p><strong>Shaw, T. E.,</strong> Buri, P., McCarthy, M., Miles, E. S., Ayala, Á., & Pellicciotti, F. (2023). The Decaying Near-Surface Boundary Layer of a Retreating Alpine Glacier. <i>Geophysical Research Letters</i>, <i>50</i>, 1–12. <a href="https://doi.org/10.1029/2023GL103043">https://doi.org/10.1029/2023GL103043</a></p><p>Strasser, U., Corripio, J. G., Pellicciotti, F., Burlando, P., Brock, B. W., & Funk, M. (2004). Spatial and temporal variability of meteorological variables at Haut Glacier d'Arolla (Switzerland) during the ablation season 2001: Measurements and simulations. Journal of Geophysical Research, 109, D03103. https://doi.org/10.1029/2003JD003973</p><p><br> -------------</p><p> </p><p>This work was funded by the EU Horizon 2020 Marie Skłodowska-Curie Actions Grant 101026058.</p>
STORM imaging of Bacillus subtilis labeled by fluorescent d-amino acids
<p>Bacillus subtilus cells were labeled by fluorescent d-amino acids, followed by STORM super-resolution imaging.</p> <p>The wide-field image and STORM imaging stack are uploaded.</p>
Metal and nutrient content from submerged aquatic macrophytes collected from Southern Coeur d'Alene Lake, Idaho (USA) in August 2018.
<p>This repository contains data and R scripts used to produce the analyses reported in the manuscript listed below. See the Readme.txt and metadata.csv files for more explanation. The .R file can be used to unbundle the .tar.gz file via the packrat library. The data and script files are contained in the .tar.gz file. </p> <p>Scofield, B.D., Fields, S.F. & Chess, D.W. Aquatic macrophytes show distinct spatial trends in contaminant metal and nutrient concentrations in Coeur d’Alene Lake, USA. <em>Environ Sci Pollut Res</em> (2023). <a href="https://doi.org/10.1007/s11356-023-27211-x">https://doi.org/10.1007/s11356-023-27211-x</a></p>
Systematic revision of the Spotted and Northern Dusky Salamanders (Plethodontidae: Desmognathus conanti and D. fuscus), with six new species from the eastern United States
<p>Appendix S1 - Specimen, locality, and morphometric data for 674 individual salamanders analyzed in this study. We used the ‘geomorph’ package in R (Adams and Otárola-Castillo 2013) to extract 17 measurements at 0.01mm precision: SVL (snout-vent length), TL (tail length), AG (axilla-groin length), CW (chest width), FL (femur length), HL (humerus length), SG (snout-gular length), TW (tail width at rear of vent), TO (length of third toe), FI (length of third finger), HW (head width), ED (eye diameter), IN (internarial distance), ES (eye-snout distance), ON (orbito-narial distance), IO (inter-orbital distance), and IC (inter-canthal distance).</p>
Dataset for the publication: Electrochemical transformation of D,L-glutamic acid into acrylonitrile
<p>The dataset comprehends the experimental data used as basis of the contribution on the electrochemical transformation of D,L-glutamic acid into acrylonitrile. The electrochemical transformation of D,L‑glutamic acid as substrate proceeds in several steps via electro-oxidative decarboxylation and non-Kolbe electrolysis. The provided data comprehend yields and faradaic efficiencies of the transformations under different reaction conditions.</p>
Data associated with the Turbet et al. 2023 manuscript (GCM simulations of TRAPPIST-1b, c and d)
<p>GCM simulations of TRAPPIST-1b, c and d, assuming H2O- and CO2-dominated atmospheres (in netCDF format). The GCM simulations were performed with the Generic PCM, historically known as the LMD Generic GCM. The simulations were used in the Turbet et al. 2023 manuscript.</p>
Specialized vitamin D databases- European collection and USDA SR26 collection
<p>These two data sets are collections of best quality data on vitamin D content in foods, available in Europe (hosted by EuroFIR<sup>TM</sup>) and in US (hosted by USDA- in SR26). Data was collected in period of 2014-2015. Search criteria included analytical and manufactures' data sources, and these are sorted in food groups and vitamin D forms- vitamin D total (expressed in ug/100g or IU, and converted to ug), vitamin D3 (ug/100g), vitamin D2 (ug/100g), vitamin 25OHD (ug/100g). </p> <p>A manuscript describing creation process of these two dataset is uploaded as well. </p>
Datasets supporting the publication "Technical Note: in-situ measurements and modelling of the oxidation kinetics in films of a cooking aerosol proxy using a Quartz Crystal Microbalance with Dissipation monitoring (QCM-D)" by Milsom et al.
<p>Supporting experimental and modelling data for the manuscript entitled "Technical Note: Modelling and in-situ measurements of the oxidation kinetics in films of a cooking aerosol proxy using a Quartz Crystal Microbalance with Dissipation monitoring (QCM-D)" by Adam Milsom et al. 2023. </p> <p>Includes raw QCM-D data with the numbers at the beginning of the files corresponding to the experiment numbers in the manuscript. </p> <p>Normalised Raman peak area data for modelling and model ensemble outputs, including uptake coefficients. </p>
Orthophoto issue d'images de drone,Terre Sainte à Saint Pierre,Réunion,France - 20230722 - Mavic2Pro_02_1
<p>Ce jeu de données présente les résultats des traitements photogrammétriques d’images de drone acquises sur le site de la petite plage de Terre Sainte, Saint Pierre, Réunion.</p> <p>Les traitements ont été réalisés avec le logiciel OpenDroneMap à partir des images brutes fournies dans la première version de ce DOI. Les vols ont été réalisées par l'IRD</p> <p>.<br> Le paramétrage du logiciel OpenDroneMap est partagé pour permettre la reproductibilité ou l'amélioration des traitements proposés.</p> <p>Le dépôt est composé des éléments suivants:<br> - <strong>uav_2023_07_20_terre-sainte_Mavic2Pro_02_1.tif</strong>: Orthophoto issue du traitement OpenDroneMap <br> - <strong>photogrammetry_config.json</strong>: Configuration OpenDroneMap</p> <p><strong>Camera model and parameters:</strong> <br> Make: Hasselblad <br> Model: L1D-20c <br> Width: 5472 <br> Height: 3648 <br> Focal: 28<br> No images: 264</p> <p><strong>Survey informations:</strong><br> Median height: 92 meters<br> Survey area: 6.95 hectares<br> Survey from:08:49:12 to:09:02:51<br> </p>
Data from: Identifying priority areas for spatial management of mixed fisheries using ensemble of multi-species distribution models. Panzeri D. et al., 2023, Fish and Fisheries
<p>Panzeri D.<sup>1</sup>, Russo T., Arneri E., Carlucci R., Cossarini G., Isajlović I., Krstulović Šifner S., Manfredi C., Masnadi F., Reale M., Scarcella G., Solidoro C., Spedicato M.T., Vrgoč N., W. Zupa, Libralato S<sup>2</sup>.</p> <p><sup>1 </sup>dpanzeri@ogs.it<br> <sup>2 </sup>slibralato@ogs.it</p> <p>Spatial fisheries management is widely used to reduce overfishing, rebuild stocks, and protect biodiversity. However, the effectiveness and optimization of spatial measures depend on accurately identifying ecologically meaningful areas, which can be difficult in mixed fisheries. To apply a method generally to a range of target species, we developed an ensemble of species distribution models (e-SDM) that combines general additive models, generalized linear mixed models, random forest, and gradient-boosting machine methods in a training and testing protocol. The e-SDM was used to integrate density indices from two scientific bottom trawl surveys with the geopositional data, relevant oceanographic variables from the three-dimensional physical-biogeochemical operational model, and fishing effort from the vessel monitoring system. The determined best distributions for juveniles and adults are used to determine hot spots of aggregation based on single or multiple target species. We applied e-SDM to juvenile and adult stages of 10 marine demersal species representing 60% of the total demersal landings in the central areas of the Mediterranean Sea. Using the e-SDM results, hot spots of aggregation and grounds potentially more selective were identified for each species and for the target species group of otter trawl and beam trawl fisheries. The results confirm the ecological appropriateness of existing fishery restriction areas and support the identification of locations for new spatial management measures.</p> <p>Data (csv) for Panzeri et al. 2023</p> <p>1. <a href="https://zenodo.org/api/files/0b1b7af4-6a3b-481d-8d5f-57cf02d20eaa/Ensemble_density_F%26F_D.Panzeri_et_al_2023.csv">Ensemble_density_F&F_D.Panzeri_et_al_2023.csv: CSV file with density values (column pred) in terms of number of individuals (log N/km2) for each species (column sp) and life stage (column age) for each grid cell (X = longitude and Y = latitude).</a> </p> <p>2. <a href="https://zenodo.org/api/files/0b1b7af4-6a3b-481d-8d5f-57cf02d20eaa/Ensemble_density_F%26F_D.Panzeri_et_al_2023.csv">Getis_hotspot_F&F_D.Panzeri_et_al_2023.csv: CSV file with Getis ord Gi* values (column Gi) derived from the previous file 1, developed for each species and life stage for each grid cell (X = longitude and Y = latitude).</a></p> <p>3. <a href="https://zenodo.org/api/files/0b1b7af4-6a3b-481d-8d5f-57cf02d20eaa/Ensemble_density_F%26F_D.Panzeri_et_al_2023.csv">Multispecies_HotSpot_F&F_D.Panzeri_et_al_2023.csv: Frequency map expressed as the number of species for each grid cell (column freq) that has the hotspot (previous file 2) above the third quartile.</a></p> <p> </p> <p> </p>
"Orthophoto & DEM (MNE) issues d'images de drone, Mitsamiouli, Comores - 20230626"
"Ce jeu de données présente les résultats des traitements photogrammétriques d'images de drone acquises sur le site de Mitsamiouli, Grande Comore, Comores à la date suivante : 20230626. <br>Les traitements ont été réalisés avec le logiciel OpenDroneMap à partir des images brutes fournies dans la première version de ce DOI. <br>Les vols ont été réalisés en partenariat avec la DGSC (Direction Générale de la Sécurité Civile, Comores) dans le but de créer des modèles numériques d'élévations pour cartographier les risques naturels d'inondations ou de submersion marine. <br><br>Le paramétrage du logiciel OpenDroneMap est partagé pour permettre la reproductibilité ou l'amélioration des traitements proposés:<br> [ <br> { <br> 'name': 'orthophoto-resolution', <br> 'value': 1 <br> }, <br> { <br> 'name': 'auto-boundary', <br> 'value': true <br> }, <br> { <br> 'name': 'dem-resolution', <br> 'value': '2.0' <br> }, <br> { <br> 'name': 'dsm', <br> 'value': true <br> } <br> ] <br> <br><b>Le dépôt est composé des éléments suivants:</b> <br> - 00_: Planche d'aperçu des images <br> - 000_photogrammetry_report.pdf: rapport issu du traitement OpenDroneMap <br> - DCIM.zip: Images brutes issues du drone <br> - GPS.zip: Geopackage contenant l'emprise du survol ainsi que la géolocalisation des images accompagnées de leurs miniatures dans la table d'attribut en base64 <br> - METADATA.zip: Métadonnées au format ISO19115, Rapports avec miniatures des images de drone (dossier tb) et statistiques de vols. <br> - PROCESSED_DATA.zip: Orthophoto, DEM, nuages de points, ... <br> <br><b>Arborescence d'origine:</b> <br>└─ 20230626_COM-mitsamiouli_UAV-01_2 <br> └─ DCIM <br> └─ GPS <br> └─ METADATA <br> └─ tb <br> └─ PROCESSED_DATA <br> <br> <br><b>Informations de survol:</b> <br>- Camera model and parameters: <br> Make: Hasselblad <br> Model: L1D-20c <br> Width: 5472 <br> Height: 3648 <br> Focal: 28 <br> WhiteBalance: Auto <br> ExposureMode: Auto Exposure <br> ColoSpace: sRGB <br> EV: -0.7 <br> MeteringMode: CenterWeightedAverage <br> Camera Pitch: -90.00 <br> <br>- Survey informations: <br> No Images: 255 <br> Median height: 120 meters <br> Survey area: 30.56 hectares <br> Survey from: 2023:06:27 12:30:25 to: 2023:06:27 12:44:19 <br> <br>Les dépôts suivants comprennent les données traitées avec OpenDroneMap"
"Orthophoto & DEM (MNE) issues d'images de drone, Maloudja, Comores - 20230628"
"Ce jeu de données présente les résultats des traitements photogrammétriques d'images de drone acquises sur le site de Maloudja, Grande Comore, Comores à la date suivante : 20230628. <br>Les traitements ont été réalisés avec le logiciel OpenDroneMap à partir des images brutes fournies dans la première version de ce DOI. <br>Les vols ont été réalisés en partenariat avec la DGSC (Direction Générale de la Sécurité Civile, Comores) dans le but de créer des modèles numériques d'élévations pour cartographier les risques naturels d'inondations ou de submersion marine. <br><br>Le paramétrage du logiciel OpenDroneMap est partagé pour permettre la reproductibilité ou l'amélioration des traitements proposés:<br> [ <br> { <br> 'name': 'orthophoto-resolution', <br> 'value': 1 <br> }, <br> { <br> 'name': 'auto-boundary', <br> 'value': true <br> }, <br> { <br> 'name': 'dem-resolution', <br> 'value': '2.0' <br> }, <br> { <br> 'name': 'dsm', <br> 'value': true <br> } <br> ] <br> <br><b>Le dépôt est composé des éléments suivants:</b> <br> - 00_: Planche d'aperçu des images <br> - 000_photogrammetry_report.pdf: rapport issu du traitement OpenDroneMap <br> - DCIM.zip: Images brutes issues du drone <br> - GPS.zip: Geopackage contenant l'emprise du survol ainsi que la géolocalisation des images accompagnées de leurs miniatures dans la table d'attribut en base64 <br> - METADATA.zip: Métadonnées au format ISO19115, Rapports avec miniatures des images de drone (dossier tb) et statistiques de vols. <br> - PROCESSED_DATA.zip: Orthophoto, DEM, nuages de points, ... <br> <br><b>Arborescence d'origine:</b> <br>└─ 20230628_COM-maloudja_UAV-02_2 <br> └─ DCIM <br> └─ GPS <br> └─ METADATA <br> └─ tb <br> └─ PROCESSED_DATA <br> <br> <br><b>Informations de survol:</b> <br>- Camera model and parameters: <br> Make: Hasselblad <br> Model: L1D-20c <br> Width: 5472 <br> Height: 3648 <br> Focal: 28 <br> WhiteBalance: Manual <br> ExposureMode: Auto Exposure <br> ColoSpace: sRGB <br> EV: -0.7 <br> MeteringMode: CenterWeightedAverage <br> Camera Pitch: -90.00 <br> <br>- Survey informations: <br> No Images: 147 <br> Median height: 120 meters <br> Survey area: 24.07 hectares <br> Survey from: 2023:06:28 17:55:53 to: 2023:06:28 18:07:38 <br> <br>Les dépôts suivants comprennent les données traitées avec OpenDroneMap"
"Orthophoto & DEM (MNE) issues d'images de drone, Bandamaji, Comores - 20230626"
"Ce jeu de données présente les résultats des traitements photogrammétriques d'images de drone acquises sur le site de Bandamaji, Grande Comore, Comores à la date suivante : 20230626. <br>Les traitements ont été réalisés avec le logiciel OpenDroneMap à partir des images brutes fournies dans la première version de ce DOI. <br>Les vols ont été réalisés en partenariat avec la DGSC (Direction Générale de la Sécurité Civile, Comores) dans le but de créer des modèles numériques d'élévations pour cartographier les risques naturels d'inondations ou de submersion marine. <br><br>Le paramétrage du logiciel OpenDroneMap est partagé pour permettre la reproductibilité ou l'amélioration des traitements proposés:<br> [ <br> { <br> 'name': 'orthophoto-resolution', <br> 'value': 1 <br> }, <br> { <br> 'name': 'auto-boundary', <br> 'value': true <br> }, <br> { <br> 'name': 'dem-resolution', <br> 'value': '2.0' <br> }, <br> { <br> 'name': 'dsm', <br> 'value': true <br> } <br> ] <br> <br><b>Le dépôt est composé des éléments suivants:</b> <br> - 00_: Planche d'aperçu des images <br> - 000_photogrammetry_report.pdf: rapport issu du traitement OpenDroneMap <br> - DCIM.zip: Images brutes issues du drone <br> - GPS.zip: Geopackage contenant l'emprise du survol ainsi que la géolocalisation des images accompagnées de leurs miniatures dans la table d'attribut en base64 <br> - METADATA.zip: Métadonnées au format ISO19115, Rapports avec miniatures des images de drone (dossier tb) et statistiques de vols. <br> - PROCESSED_DATA.zip: Orthophoto, DEM, nuages de points, ... <br> <br><b>Arborescence d'origine:</b> <br>└─ 20230626_COM-bandamaji_UAV-02_1 <br> └─ DCIM <br> └─ GPS <br> └─ METADATA <br> └─ tb <br> └─ PROCESSED_DATA <br> <br> <br><b>Informations de survol:</b> <br>- Camera model and parameters: <br> Make: Hasselblad <br> Model: L1D-20c <br> Width: 5472 <br> Height: 3648 <br> Focal: 28 <br> WhiteBalance: Manual <br> ExposureMode: Auto Exposure <br> ColoSpace: sRGB <br> EV: -0.7 <br> MeteringMode: CenterWeightedAverage <br> Camera Pitch: -89.90 <br> <br>- Survey informations: <br> No Images: 335 <br> Median height: 120 meters <br> Survey area: 17.41 hectares <br> Survey from: 2023:06:26 15:53:50 to: 2023:06:26 16:07:14 <br> <br>Les dépôts suivants comprennent les données traitées avec OpenDroneMap"
"Orthophoto & DEM (MNE) issues d'images de drone, Bandamaji, Comores - 20230626"
"Ce jeu de données présente les résultats des traitements photogrammétriques d'images de drone acquises sur le site de Bandamaji, Grande Comore, Comores à la date suivante : 20230626. <br>Les traitements ont été réalisés avec le logiciel OpenDroneMap à partir des images brutes fournies dans la première version de ce DOI. <br>Les vols ont été réalisés en partenariat avec la DGSC (Direction Générale de la Sécurité Civile, Comores) dans le but de créer des modèles numériques d'élévations pour cartographier les risques naturels d'inondations ou de submersion marine. <br><br>Le paramétrage du logiciel OpenDroneMap est partagé pour permettre la reproductibilité ou l'amélioration des traitements proposés:<br> [ <br> { <br> 'name': 'orthophoto-resolution', <br> 'value': 1 <br> }, <br> { <br> 'name': 'auto-boundary', <br> 'value': true <br> }, <br> { <br> 'name': 'dem-resolution', <br> 'value': '2.0' <br> }, <br> { <br> 'name': 'dsm', <br> 'value': true <br> } <br> ] <br> <br><b>Le dépôt est composé des éléments suivants:</b> <br> - 00_: Planche d'aperçu des images <br> - 000_photogrammetry_report.pdf: rapport issu du traitement OpenDroneMap <br> - DCIM.zip: Images brutes issues du drone <br> - GPS.zip: Geopackage contenant l'emprise du survol ainsi que la géolocalisation des images accompagnées de leurs miniatures dans la table d'attribut en base64 <br> - METADATA.zip: Métadonnées au format ISO19115, Rapports avec miniatures des images de drone (dossier tb) et statistiques de vols. <br> - PROCESSED_DATA.zip: Orthophoto, DEM, nuages de points, ... <br> <br><b>Arborescence d'origine:</b> <br>└─ 20230626_COM-bandamaji_UAV-01_1 <br> └─ DCIM <br> └─ GPS <br> └─ METADATA <br> └─ tb <br> └─ PROCESSED_DATA <br> <br> <br><b>Informations de survol:</b> <br>- Camera model and parameters: <br> Make: Hasselblad <br> Model: L1D-20c <br> Width: 5472 <br> Height: 3648 <br> Focal: 28 <br> WhiteBalance: Auto <br> ExposureMode: Auto Exposure <br> ColoSpace: sRGB <br> EV: -0.7 <br> MeteringMode: CenterWeightedAverage <br> Camera Pitch: -89.90 <br> <br>- Survey informations: <br> No Images: 102 <br> Median height: 100 meters <br> Survey area: 4.57 hectares <br> Survey from: 2023:06:26 15:34:52 to: 2023:06:26 15:39:22 <br> <br>Les dépôts suivants comprennent les données traitées avec OpenDroneMap"
"Orthophoto & DEM (MNE) issues d'images de drone, Mitsamiouli, Comores - 20230626"
"Ce jeu de données présente les résultats des traitements photogrammétriques d'images de drone acquises sur le site de Mitsamiouli, Grande Comore, Comores à la date suivante : 20230626. <br>Les traitements ont été réalisés avec le logiciel OpenDroneMap à partir des images brutes fournies dans la première version de ce DOI. <br>Les vols ont été réalisés en partenariat avec la DGSC (Direction Générale de la Sécurité Civile, Comores) dans le but de créer des modèles numériques d'élévations pour cartographier les risques naturels d'inondations ou de submersion marine. <br><br>Le paramétrage du logiciel OpenDroneMap est partagé pour permettre la reproductibilité ou l'amélioration des traitements proposés:<br> [ <br> { <br> 'name': 'orthophoto-resolution', <br> 'value': 1 <br> }, <br> { <br> 'name': 'auto-boundary', <br> 'value': true <br> }, <br> { <br> 'name': 'dem-resolution', <br> 'value': '2.0' <br> }, <br> { <br> 'name': 'dsm', <br> 'value': true <br> } <br> ] <br> <br><b>Le dépôt est composé des éléments suivants:</b> <br> - 00_: Planche d'aperçu des images <br> - 000_photogrammetry_report.pdf: rapport issu du traitement OpenDroneMap <br> - DCIM.zip: Images brutes issues du drone <br> - GPS.zip: Geopackage contenant l'emprise du survol ainsi que la géolocalisation des images accompagnées de leurs miniatures dans la table d'attribut en base64 <br> - METADATA.zip: Métadonnées au format ISO19115, Rapports avec miniatures des images de drone (dossier tb) et statistiques de vols. <br> - PROCESSED_DATA.zip: Orthophoto, DEM, nuages de points, ... <br> <br><b>Arborescence d'origine:</b> <br>└─ 20230626_COM-mitsamiouli_UAV-02_1 <br> └─ DCIM <br> └─ GPS <br> └─ METADATA <br> └─ tb <br> └─ PROCESSED_DATA <br> <br> <br><b>Informations de survol:</b> <br>- Camera model and parameters: <br> Make: Hasselblad <br> Model: L1D-20c <br> Width: 5472 <br> Height: 3648 <br> Focal: 28 <br> WhiteBalance: Manual <br> ExposureMode: Auto Exposure <br> ColoSpace: sRGB <br> EV: -0.7 <br> MeteringMode: CenterWeightedAverage <br> Camera Pitch: -90.00 <br> <br>- Survey informations: <br> No Images: 162 <br> Median height: 120 meters <br> Survey area: 25.96 hectares <br> Survey from: 2023:06:27 12:18:21 to: 2023:06:27 12:29:24 <br> <br>Les dépôts suivants comprennent les données traitées avec OpenDroneMap"
"Orthophoto & DEM (MNE) issues d'images de drone, Vouvouni, Comores - 20230627"
"Ce jeu de données présente les résultats des traitements photogrammétriques d'images de drone acquises sur le site de Vouvouni, Grande Comore, Comores à la date suivante : 20230627. <br>Les traitements ont été réalisés avec le logiciel OpenDroneMap à partir des images brutes fournies dans la première version de ce DOI. <br>Les vols ont été réalisés en partenariat avec la DGSC (Direction Générale de la Sécurité Civile, Comores) dans le but de créer des modèles numériques d'élévations pour cartographier les risques naturels d'inondations ou de submersion marine. <br><br>Le paramétrage du logiciel OpenDroneMap est partagé pour permettre la reproductibilité ou l'amélioration des traitements proposés:<br> [ <br> { <br> 'name': 'orthophoto-resolution', <br> 'value': 1 <br> }, <br> { <br> 'name': 'auto-boundary', <br> 'value': true <br> }, <br> { <br> 'name': 'dem-resolution', <br> 'value': '2.0' <br> }, <br> { <br> 'name': 'dsm', <br> 'value': true <br> } <br> ] <br> <br><b>Le dépôt est composé des éléments suivants:</b> <br> - 00_: Planche d'aperçu des images <br> - 000_photogrammetry_report.pdf: rapport issu du traitement OpenDroneMap <br> - DCIM.zip: Images brutes issues du drone <br> - GPS.zip: Geopackage contenant l'emprise du survol ainsi que la géolocalisation des images accompagnées de leurs miniatures dans la table d'attribut en base64 <br> - METADATA.zip: Métadonnées au format ISO19115, Rapports avec miniatures des images de drone (dossier tb) et statistiques de vols. <br> - PROCESSED_DATA.zip: Orthophoto, DEM, nuages de points, ... <br> <br><b>Arborescence d'origine:</b> <br>└─ 20230627_COM-vouvouni_UAV-01_2 <br> └─ DCIM <br> └─ GPS <br> └─ METADATA <br> └─ tb <br> └─ PROCESSED_DATA <br> <br> <br><b>Informations de survol:</b> <br>- Camera model and parameters: <br> Make: Hasselblad <br> Model: L1D-20c <br> Width: 5472 <br> Height: 3648 <br> Focal: 28 <br> WhiteBalance: Auto <br> ExposureMode: Auto Exposure <br> ColoSpace: sRGB <br> EV: -0.7 <br> MeteringMode: CenterWeightedAverage <br> Camera Pitch: -89.90 <br> <br>- Survey informations: <br> No Images: 205 <br> Median height: 120 meters <br> Survey area: 12.86 hectares <br> Survey from: 2023:06:27 15:49:48 to: 2023:06:27 15:58:39 <br> <br>Les dépôts suivants comprennent les données traitées avec OpenDroneMap"
"Orthophoto & DEM (MNE) issues d'images de drone, Bandamaji, Comores - 20230626"
"Ce jeu de données présente les résultats des traitements photogrammétriques d'images de drone acquises sur le site de Bandamaji, Grande Comore, Comores à la date suivante : 20230626. <br>Les traitements ont été réalisés avec le logiciel OpenDroneMap à partir des images brutes fournies dans la première version de ce DOI. <br>Les vols ont été réalisés en partenariat avec la DGSC (Direction Générale de la Sécurité Civile, Comores) dans le but de créer des modèles numériques d'élévations pour cartographier les risques naturels d'inondations ou de submersion marine. <br><br>Le paramétrage du logiciel OpenDroneMap est partagé pour permettre la reproductibilité ou l'amélioration des traitements proposés:<br> [ <br> { <br> 'name': 'orthophoto-resolution', <br> 'value': 1 <br> }, <br> { <br> 'name': 'auto-boundary', <br> 'value': true <br> }, <br> { <br> 'name': 'dem-resolution', <br> 'value': '2.0' <br> }, <br> { <br> 'name': 'dsm', <br> 'value': true <br> } <br> ] <br> <br><b>Le dépôt est composé des éléments suivants:</b> <br> - 00_: Planche d'aperçu des images <br> - 000_photogrammetry_report.pdf: rapport issu du traitement OpenDroneMap <br> - DCIM.zip: Images brutes issues du drone <br> - GPS.zip: Geopackage contenant l'emprise du survol ainsi que la géolocalisation des images accompagnées de leurs miniatures dans la table d'attribut en base64 <br> - METADATA.zip: Métadonnées au format ISO19115, Rapports avec miniatures des images de drone (dossier tb) et statistiques de vols. <br> - PROCESSED_DATA.zip: Orthophoto, DEM, nuages de points, ... <br> <br><b>Arborescence d'origine:</b> <br>└─ 20230626_COM-bandamaji_UAV-01_2 <br> └─ DCIM <br> └─ GPS <br> └─ METADATA <br> └─ tb <br> └─ PROCESSED_DATA <br> <br> <br><b>Informations de survol:</b> <br>- Camera model and parameters: <br> Make: Hasselblad <br> Model: L1D-20c <br> Width: 5472 <br> Height: 3648 <br> Focal: 28 <br> WhiteBalance: Auto <br> ExposureMode: Auto Exposure <br> ColoSpace: sRGB <br> EV: -0.7 <br> MeteringMode: CenterWeightedAverage <br> Camera Pitch: -70.00 <br> <br>- Survey informations: <br> No Images: 104 <br> Median height: 100 meters <br> Survey area: 4.95 hectares <br> Survey from: 2023:06:26 15:51:39 to: 2023:06:26 15:58:55 <br> <br>Les dépôts suivants comprennent les données traitées avec OpenDroneMap"
"Orthophoto & DEM (MNE) issues d'images de drone, Nioumadzaha mitsoudje, Comores - 20230701"
"Ce jeu de données présente les résultats des traitements photogrammétriques d'images de drone acquises sur le site de Nioumadzaha mitsoudje, Grande Comore, Comores à la date suivante : 20230701. <br>Les traitements ont été réalisés avec le logiciel OpenDroneMap à partir des images brutes fournies dans la première version de ce DOI. <br>Les vols ont été réalisés en partenariat avec la DGSC (Direction Générale de la Sécurité Civile, Comores) dans le but de créer des modèles numériques d'élévations pour cartographier les risques naturels d'inondations ou de submersion marine. <br><br>Le paramétrage du logiciel OpenDroneMap est partagé pour permettre la reproductibilité ou l'amélioration des traitements proposés:<br> [ <br> { <br> 'name': 'orthophoto-resolution', <br> 'value': 1 <br> }, <br> { <br> 'name': 'auto-boundary', <br> 'value': true <br> }, <br> { <br> 'name': 'dem-resolution', <br> 'value': '2.0' <br> }, <br> { <br> 'name': 'dsm', <br> 'value': true <br> } <br> ] <br> <br><b>Le dépôt est composé des éléments suivants:</b> <br> - 00_: Planche d'aperçu des images <br> - 000_photogrammetry_report.pdf: rapport issu du traitement OpenDroneMap <br> - DCIM.zip: Images brutes issues du drone <br> - GPS.zip: Geopackage contenant l'emprise du survol ainsi que la géolocalisation des images accompagnées de leurs miniatures dans la table d'attribut en base64 <br> - METADATA.zip: Métadonnées au format ISO19115, Rapports avec miniatures des images de drone (dossier tb) et statistiques de vols. <br> - PROCESSED_DATA.zip: Orthophoto, DEM, nuages de points, ... <br> <br><b>Arborescence d'origine:</b> <br>└─ 20230701_COM-nioumadzaha-mitsoudje_UAV-01_2 <br> └─ DCIM <br> └─ GPS <br> └─ METADATA <br> └─ tb <br> └─ PROCESSED_DATA <br> <br> <br><b>Informations de survol:</b> <br>- Camera model and parameters: <br> Make: Hasselblad <br> Model: L1D-20c <br> Width: 5472 <br> Height: 3648 <br> Focal: 28 <br> WhiteBalance: Auto <br> ExposureMode: Auto Exposure <br> ColoSpace: sRGB <br> EV: -1.0 <br> MeteringMode: CenterWeightedAverage <br> Camera Pitch: -90.00 <br> <br>- Survey informations: <br> No Images: 245 <br> Median height: 120 meters <br> Survey area: 33.75 hectares <br> Survey from: 2023:07:01 10:25:37 to: 2023:07:01 10:40:14 <br> <br>Les dépôts suivants comprennent les données traitées avec OpenDroneMap"
"Orthophoto & DEM (MNE) issues d'images de drone, Nioumadzaha mitsoudje, Comores - 20230701"
"Ce jeu de données présente les résultats des traitements photogrammétriques d'images de drone acquises sur le site de Nioumadzaha mitsoudje, Grande Comore, Comores à la date suivante : 20230701. <br>Les traitements ont été réalisés avec le logiciel OpenDroneMap à partir des images brutes fournies dans la première version de ce DOI. <br>Les vols ont été réalisés en partenariat avec la DGSC (Direction Générale de la Sécurité Civile, Comores) dans le but de créer des modèles numériques d'élévations pour cartographier les risques naturels d'inondations ou de submersion marine. <br><br>Le paramétrage du logiciel OpenDroneMap est partagé pour permettre la reproductibilité ou l'amélioration des traitements proposés:<br> [ <br> { <br> 'name': 'orthophoto-resolution', <br> 'value': 1 <br> }, <br> { <br> 'name': 'auto-boundary', <br> 'value': true <br> }, <br> { <br> 'name': 'dem-resolution', <br> 'value': '2.0' <br> }, <br> { <br> 'name': 'dsm', <br> 'value': true <br> } <br> ] <br> <br><b>Le dépôt est composé des éléments suivants:</b> <br> - 00_: Planche d'aperçu des images <br> - 000_photogrammetry_report.pdf: rapport issu du traitement OpenDroneMap <br> - DCIM.zip: Images brutes issues du drone <br> - GPS.zip: Geopackage contenant l'emprise du survol ainsi que la géolocalisation des images accompagnées de leurs miniatures dans la table d'attribut en base64 <br> - METADATA.zip: Métadonnées au format ISO19115, Rapports avec miniatures des images de drone (dossier tb) et statistiques de vols. <br> - PROCESSED_DATA.zip: Orthophoto, DEM, nuages de points, ... <br> <br><b>Arborescence d'origine:</b> <br>└─ 20230701_COM-nioumadzaha-mitsoudje_UAV-02_1 <br> └─ DCIM <br> └─ GPS <br> └─ METADATA <br> └─ tb <br> └─ PROCESSED_DATA <br> <br> <br><b>Informations de survol:</b> <br>- Camera model and parameters: <br> Make: Hasselblad <br> Model: L1D-20c <br> Width: 5472 <br> Height: 3648 <br> Focal: 28 <br> WhiteBalance: Manual <br> ExposureMode: Auto Exposure <br> ColoSpace: sRGB <br> EV: -0.7 <br> MeteringMode: CenterWeightedAverage <br> Camera Pitch: -89.90 <br> <br>- Survey informations: <br> No Images: 565 <br> Median height: 120 meters <br> Survey area: 1139.28 hectares <br> Survey from: 2023:06:26 15:59:22 to: 2023:07:01 11:36:44 <br> <br>Les dépôts suivants comprennent les données traitées avec OpenDroneMap"
"Orthophoto & DEM (MNE) issues d'images de drone, Bangoua kouni, Comores - 20230626"
"Ce jeu de données présente les résultats des traitements photogrammétriques d'images de drone acquises sur le site de Bangoua kouni, Grande Comore, Comores à la date suivante : 20230626. <br>Les traitements ont été réalisés avec le logiciel OpenDroneMap à partir des images brutes fournies dans la première version de ce DOI. <br>Les vols ont été réalisés en partenariat avec la DGSC (Direction Générale de la Sécurité Civile, Comores) dans le but de créer des modèles numériques d'élévations pour cartographier les risques naturels d'inondations ou de submersion marine. <br><br>Le paramétrage du logiciel OpenDroneMap est partagé pour permettre la reproductibilité ou l'amélioration des traitements proposés:<br> [ <br> { <br> 'name': 'orthophoto-resolution', <br> 'value': 1 <br> }, <br> { <br> 'name': 'auto-boundary', <br> 'value': true <br> }, <br> { <br> 'name': 'dem-resolution', <br> 'value': '2.0' <br> }, <br> { <br> 'name': 'dsm', <br> 'value': true <br> } <br> ] <br> <br><b>Le dépôt est composé des éléments suivants:</b> <br> - 00_: Planche d'aperçu des images <br> - 000_photogrammetry_report.pdf: rapport issu du traitement OpenDroneMap <br> - DCIM.zip: Images brutes issues du drone <br> - GPS.zip: Geopackage contenant l'emprise du survol ainsi que la géolocalisation des images accompagnées de leurs miniatures dans la table d'attribut en base64 <br> - METADATA.zip: Métadonnées au format ISO19115, Rapports avec miniatures des images de drone (dossier tb) et statistiques de vols. <br> - PROCESSED_DATA.zip: Orthophoto, DEM, nuages de points, ... <br> <br><b>Arborescence d'origine:</b> <br>└─ 20230626_COM-bangoua-kouni_UAV-02_1 <br> └─ DCIM <br> └─ GPS <br> └─ METADATA <br> └─ tb <br> └─ PROCESSED_DATA <br> <br> <br><b>Informations de survol:</b> <br>- Camera model and parameters: <br> Make: Hasselblad <br> Model: L1D-20c <br> Width: 5472 <br> Height: 3648 <br> Focal: 28 <br> WhiteBalance: Manual <br> ExposureMode: Auto Exposure <br> ColoSpace: sRGB <br> EV: -0.7 <br> MeteringMode: CenterWeightedAverage <br> Camera Pitch: -89.90 <br> <br>- Survey informations: <br> No Images: 301 <br> Median height: 120 meters <br> Survey area: 43.02 hectares <br> Survey from: 2023:06:27 10:32:22 to: 2023:06:27 10:49:42 <br> <br>Les dépôts suivants comprennent les données traitées avec OpenDroneMap"
ScienceDex guides
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These curated guides explain access requirements, typical timelines, costs, and reuse considerations for widely used research datasets.
Allen Brain Atlas
Allen Brain Atlas is an Allen Institute collection of brain map atlases, datasets, APIs, and analysis tools covering mouse, human, and non-human primate brain resources.
Annotated Behaviour and Observability Dataset (ABODe)
ABODe is a University of Edinburgh DataShare dataset for behavior classification in group-housed mice using home-cage video, identities, bounding boxes, ground-plate positions, and annotator labels.
DANDI Archive for NWB datasets
DANDI is a BRAIN Initiative archive for publishing and sharing neurophysiology data, including electrophysiology, optophysiology, and behavioral data packaged as NWB and related standards.
International Brain Laboratory public data
The International Brain Laboratory public data releases expose standardized mouse decision-making experiments, including Neuropixels recordings, widefield calcium imaging, behavior, and session metadata accessed through the ONE API.
OpenNeuro
OpenNeuro is a free, open platform for sharing neuroimaging datasets, with public search, dataset pages, and download paths for web, S3, DataLad, and the OpenNeuro CLI.