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FIG. 10 in L'apport du registre paléogène d'Amazonie sur la diversification initiale des Caviomorpha (Hystricognathi, Rodentia): implications phylogénétiques, macroévolutives et paléobiogéographiques
FIG. 10. — Mise en contexte paléogéographique de la topologie obtenue en AG9 (AG1 + Loretomys; voir Annexe 4).
FIG. 9 in L'apport du registre paléogène d'Amazonie sur la diversification initiale des Caviomorpha (Hystricognathi, Rodentia): implications phylogénétiques, macroévolutives et paléobiogéographiques
FIG. 9. — Mise en contexte géologique (Amérique du Sud; Hoorn et al. 2010a) et climatique (variations globales du δ180; Zachos et al. 2001, 2008) des trois phases de diversifications des caviomorphes (en vert) au Paléogène et Miocène. La topologie de l'arbre est celle obtenue dans l'AG1 (Fig. 5). Le code couleur est le même que celui de la Figure 3. Abréviations: MECO, optimum climatique de l'Éocène moyen; EOTc, refroidissement de la transition Éocène-Oligocène; OMBc, refroidissement de la transition Oligocène-Miocène.
FIG. 8 in L'apport du registre paléogène d'Amazonie sur la diversification initiale des Caviomorpha (Hystricognathi, Rodentia): implications phylogénétiques, macroévolutives et paléobiogéographiques
FIG. 8. — Résultats phylogénétiques de l'AG1 (Fig. 5), replacés dans un contexte stratigraphique. Le code couleur est le même que celui de la Figure 3.
FIG. 7 in L'apport du registre paléogène d'Amazonie sur la diversification initiale des Caviomorpha (Hystricognathi, Rodentia): implications phylogénétiques, macroévolutives et paléobiogéographiques
FIG. 7. — Caractère « taille » (i.e., longueur) des dents, reporté a posteriori sur la topologie de l'AG1 (Fig. 5) avec le logiciel Mesquite v.2.72 (Maddison & Maddison 2009). Ce caractère a été ordonné et a été codé pour l'ensemble des taxons.
FIG. 2 in L'apport du registre paléogène d'Amazonie sur la diversification initiale des Caviomorpha (Hystricognathi, Rodentia): implications phylogénétiques, macroévolutives et paléobiogéographiques
FIG. 2. — Nomenclature des dents inférieures utilisée dans le présent travail, basée sur celle proposée dans Boivin et al. (2017b): A, B, molaire inférieure, vue occlusale; A, molaire tétralophodonte; B, molaire trilophodonte/tétralophodonte; C, P4, vue occlusale; D, dP4, vue occlusale; E, F, dent supérieure; E, vue labiale; F, vue linguale. Abréviations: ant, antérieur; ling, lingual; 1, protoconide; 2, métaconide; 3, mésoconide; 4, entoconide; 5, hypoconide; 6, mésostylide; 7, métalophulide I; 8, bras postérieur du métaconide; 9, bras postérieur du protoconide; 10, néomésolophide; 11, deuxième cristide transverse; 12, mésolophide; 13, reste de mésolophide?; 14, ectolophide; 15, ectolophide mésial; 16, ectolophid distal; 17, hypolophide; 18, bras antérieur de l'entoconide; 19, bras postérieur de l'entoconide; 20, bras antérieur de l'hypoconide; 21, bras postérieur de l'hypoconide; 22, excroissance antérieure de l'hypoconide; 23, postérolophide; 24, antéroflexide/antérofossettide; 25, antérostriide; 26, mésoflexide; 27, mésoflexide mésial; 28, mésoflexide distal; 29, mésostriide; 30, confluence de l'antéroflexide avec le mésoflexide; 31, hypoflexide; 32, hypostriide; 33, métaflexide; 34, métastriide; 35, confluence de l'hypoflexide avec le métaflexide.
FIG. 1 in L'apport du registre paléogène d'Amazonie sur la diversification initiale des Caviomorpha (Hystricognathi, Rodentia): implications phylogénétiques, macroévolutives et paléobiogéographiques
FIG. 1. — Nomenclature des dents supérieures utilisée dans le présent travail, basée sur celle proposée dans Boivin et al. (2017b): A, B, molaire supérieure, vue occlusale; A, molaire pentalophodonte; B, molaire tétralophodonte; C, P4, vue occlusale; D, dP4, vue occlusale; E, F, dent supérieure; E, vue linguale; F, vue labiale. Abréviations: ant, antérieur; ling, lingual; 1, paracône; 2, protocône; 3, métacône; 4, hypocône; 5, parastyle; 6, mésostyle; 7, antérolophe; 8, bras antérieur du protocône; 9, protolophe lingual (= bras postérieur du protocône); 10, excroissance postérieure du protocône; 11, protolophe (= protolophe labial); 12, mure; 13, troisième crête transverse (= crête transverse centrale); 14, mésolophule; 15, mésolophe; 16, bras antérieur de l'hypocône; 17, métalophe; 18, postérolophe; 19, paraflexus; 20, parastria; 21, hypoflexus/hypofossette; 22, confluence du paraflexus avec l'hypoflexus; 23, hypostria; 24, mésoflexus/ mésofossette mésial; 25, mésostria; 26, mésoflexus/mésofossette distal; 27, métastria; 28, confluence du mésoflexus distal avec le métaflexus; 29, métaflexus.
FIG. 4 in L'apport du registre paléogène d'Amazonie sur la diversification initiale des Caviomorpha (Hystricognathi, Rodentia): implications phylogénétiques, macroévolutives et paléobiogéographiques
FIG. 4. — Résultats de l'AG0. Consensus strict de cinq arbres équiparcimonieux de 3274,16 pas chacun (IC = 0,578; IR = 0,607). Le code couleur est le même que celui de la Figure 3. Ici, seulement les taxons actuels ont été colorés.
FIG. 5 in L'apport du registre paléogène d'Amazonie sur la diversification initiale des Caviomorpha (Hystricognathi, Rodentia): implications phylogénétiques, macroévolutives et paléobiogéographiques
FIG. 5. — Résultats de l'AG1. Consensus strict de huit arbres équiparcimonieux de 3302,65 pas chacun (IC = 0,573; IR = 0,599). Les taxons en gras sont les espèces découvertes dans le Paléogène de Contamana (Éocène et Oligocène) et à Tarapoto/Shapaja. Le code couleur est le même que celui de la Figure 3.
FIG. 6 in Restes inédits de rongeurs caviomorphes du Paléogène de la région de Juanjui (Amazonie péruvienne): systématique, implications macro-évolutives et biostratigraphiques
FIG. 6. — Images de microscopie électronique à balayage des trois sous-types d'émail multisérié (en coupe longitudinale) présents à Juanjui/Balsayacu. A, B, MUSM- 3508 (TAR-56), sous-type 1; C, D, MUSM-3531 (TAR-47), sous-type 2; E, F, MUSM-3534 (TAR-49), sous-type 2-3. Échelle: 20 µm.
FIG. 5 in Restes inédits de rongeurs caviomorphes du Paléogène de la région de Juanjui (Amazonie péruvienne): systématique, implications macro-évolutives et biostratigraphiques
FIG. 5. — Dessins des coupes transversales des incisives des localités de Juanjui et de Balsayacu. A, MUSM-3512 (TAR-55); B, MUSM-3529 (TAR-47); C, MUSM- 3526 (TAR-47); D, MUSM-3513 (TAR-55); E, MUSM-3528 (TAR-47); F, MUSM-3527 (TAR-47); G, MUSM-3519 (TAR-45); H, MUSM-3530 (TAR-47); I, MUSM-3534 (TAR-49); J, MUSM-3517 (TAR-55bis); K, MUSM-3511 (TAR-55); L, MUSM-3508 (TAR-56); M, MUSM-3509 (TAR-56); N, MUSM-3531 (TAR-47); O, MUSM-3510 (TAR-56); P, MUSM-3539 (TAR-50); Q, MUSM-3533 (TAR-49); R, MUSM-3516 (TAR-55bis); S, MUSM-3518 (TAR-55bis). Échelle: 1 mm.
FIG. 2 in Restes inédits de rongeurs caviomorphes du Paléogène de la région de Juanjui (Amazonie péruvienne): systématique, implications macro-évolutives et biostratigraphiques
FIG. 2. — Sections stratigraphiques et positions des localités fossilifères de Juanjui et de Balsayacu. A-C, section de Juanjui: A, position stratigraphique respective des localités fossilifères TAR-45, TAR-46, TAR-47, TAR-49 et TAR-50, attribuées à l'Éocène supérieur et à l'Oligocène inférieur; B, détail des microconglomérats peu consolidés à matrice jaune de TAR-47; C, vue d'ensemble de TAR-50, situé à la base d'un chenal gréso-conglomératique intercalé dans des siltites rouges de plaine d'inondation. Les conglomérats pliocènes-pléistocènes sub-horizontaux de la formation Juanjui recouvrent la série paléogène avec une spectaculaire discordance angulaire. D-F, section de Balsayacu: D, position stratigraphique respective des localités TAR-56, TAR-55 et TAR-55bis, attribuées à l'Éocène moyen-supérieur; E, détail du microconglomérat peu consolidé de TAR-56, avec de nombreux restes végétaux oxydés (bruns); F, Vue de l'affleurement incluant TAR-55 et TAR-55bis.
FIG. 1 in Restes inédits de rongeurs caviomorphes du Paléogène de la région de Juanjui (Amazonie péruvienne): systématique, implications macro-évolutives et biostratigraphiques
FIG. 1. — Localisation des sections et localités paléogènes de Juanjui et de Balsayacu, Département de San Martín, Pérou. Les localités à rongeurs paléogènes mentionnées dans le texte apparaissent en gras avec un disque rouge dans la carte du Pérou. A, carte de situation générale; B, carte géologique simplifiée de la section fossilifère de Juanjui et des localités à rongeurs; C, carte géologique simplifiée de la section fossilifère de Balsayacu et des localités à rongeurs.
FIG. 4 in Restes inédits de rongeurs caviomorphes du Paléogène de la région de Juanjui (Amazonie péruvienne): systématique, implications macro-évolutives et biostratigraphiques
FIG. 4. — Images de microscopie électronique à balayage des dents jugales de caviomorphes fossiles de la région de Juanjui et de Balsayacu. A-F, J-S, vue occlusale; G, vue labiale; H-I, vue labiale. A-N, Cachiyacuy aff. contamanensis (TAR-47): A, MUSM-3385, M gauche; B, MUSM-3386, M gauche; C, MUSM-3525, dP4 gauche; D, MUSM-3387, dp4 droite; E, MUSM-3390, m2 droite; F-I, MUSM-3391, fragment de mandibule gauche portant m1 et m2; F-G, m1-2; H, m1; I, m2; J, MUSM-3389, m1 droite; K, MUSM-3393, m2 droite; L, MUSM-3388, m2 gauche; M, MUSM-3392, m3 droite; N, MUSM-3394, m3 droite. O-P, Canaanimys aff. maquiensis (TAR-55/ TAR-55bis): O, MUSM-3371, M3 gauche; P, MUSM-3379, M3 gauche. Q Caviomorpha gen. et sp. indet. 1. (TAR-56): MUSM-3370, m3 droite. R-S, Caviomorpha gen. et sp. indet. 2 (TAR-45): R, MUSM-3381, m2 droite; S, MUSM-3380, dP4 gauche. Échelle: 1 mm.
FIG. 7 in Restes inédits de rongeurs caviomorphes du Paléogène de la région de Juanjui (Amazonie péruvienne): systématique, implications macro-évolutives et biostratigraphiques
FIG. 7. — Hypothèse d'attribution temporelle des localités de Juanjui et de Balsayacu par rapport aux principales faunes de rongeurs de l'Éocène et de l'Oligocène inférieur d'Amazonie péruvienne. Mis à part pour la section de Contamana, les âges numériques des localités et sections sont hypothétiques. Sur la section de Juanjui, l'écart temporel entre TAR-47 (Priabonien inférieur) et TAR-45/46 (Bartonien) est relatif à l'épaisseur des accumulations sédimentaires. Les fonds bleu et blanc correspondent respectivement à une influence marine et à des environnements purement dulçaquicoles. Modifié et complété d'après Antoine et al. (2016, 2017) et Boivin (2017). Abréviations: E, Est; Fm, Formation; Ma, millions d'années; O, Ouest; SALMA, South American Land Mammal Age.
FIG. 3 in Restes inédits de rongeurs caviomorphes du Paléogène de la région de Juanjui (Amazonie péruvienne): systématique, implications macro-évolutives et biostratigraphiques
FIG. 3. — Images de microscopie électronique à balayage des dents jugales de caviomorphes fossiles de la région de Juanjui et de Balsayacu en vue occlusale: A-G, Cachiyacuy cf. kummeli (TAR-55bis): A, MUSM-3372, P4 gauche; B, MUSM-3376, M2 gauche; C, MUSM-3377, M2 droite; D, MUSM-3378, M1 gauche; E, MUSM-3373, m1 gauche; F, MUSM-3375, m2 droite; G, MUSM-3374, m2 droite; H-K, Cachiyacuy aff. kummeli (TAR-47): H, MUSM-3523, P4 droite; I, MUSM-3522, m3 droite; J, MUSM-3521, m3 droite; K, MUSM-3520, dp4 gauche; L, Cachiyacuy cf. contamanensis (TAR-46): MUSM-3382, dP4 gauche; M-O, Eoespina sp. (TAR-47): M, MUSM-3383, M1-2 droite; N, MUSM-3524, M2 gauche; O, MUSM-3384, M droite; P, cf. Eoespina (TAR-56): MUSM-3369, m droite; Q, Eoincamys sp. (TAR-49): MUSM-3532, M gauche; R-T, Eoincamys aff. pascuali (TAR-50): R, MUSM-3536, P4 gauche; S, MUSM-3537, M droite; T, MUSM-3535, m gauche. Échelle: 1 mm.
FIG. 2. — A-I in Icacinaceae fossil fruits from three sites of the Paris Basin (early Eocene, France): local diversity and global biogeographic implications
FIG. 2. — A-I, Iodes passiciensis Del Rio & De Franceschi, sp. nov. (MNHN.F.44736): A, lateral view of an endocarp showing the reticulum pattern of rounded and thin ridges; B, dorsal view showing the keel, surrounding the endocarp; C, lateral view of second face of the endocarp; D, basal view; E, apical view; F, magnification showing the pores abraded; G, SEM view of wall and ridges in transversal section; H, SEM view of rounded papillae; I, same with magnification. J-Q, Iodes reidae Del Rio, Thomas & De Franceschi (MNHN.F.44737): J, lateral view of endocarp showing the reticulum pattern of rounded ridges; K, dorsal view showing the keel, surrounding the endocarp; L, lateral view of second face of endocarp; M, basal view; N, apical view; O, magnification showing the areoles from the reticulation of ridges; P, SEM view of wall and ridges in transversal section; Q, SEM view of the trace left by the vascular bundle embedded in the endocarp wall. Scale bar: A-E, 5 mm; O-Q, 1 mm; J-N, 10 mm; G, 500 µm; F, 100 µm; H, 50 µm; I, 10 µm.
FIG. 1 in Icacinaceae fossil fruits from three sites of the Paris Basin (early Eocene, France): local diversity and global biogeographic implications
FIG. 1. — Geological map showing the locations of the five sites with Icacinaceae remains in the Paris Basin. Light Grey, Cenozoic; Grey, Upper Cretaceous; Dark grey, Lower Cretaceous. Modified from "Synthèse géologique du Bassin de Paris" (Mégnien 1980).
FIG. 5 in Icacinaceae fossil fruits from three sites of the Paris Basin (early Eocene, France): local diversity and global biogeographic implications
FIG. 5. — Icacinicaryites sp. (MNHN.F.44741): A, lateral view; B, dorsal view showing the keel; C, other lateral view; D, apical view; E, basal view. Scale bar: 5 mm.
FIG. 4. — A, B in Icacinaceae fossil fruits from three sites of the Paris Basin (early Eocene, France): local diversity and global biogeographic implications
FIG. 4. — A, B, Iodes sp. (MNHN.F.8100): A, lateral view of the endocast; B, vascular bundle embedded on the endocarp wall (arrow); C, Palaeophytocrene sp. (MNHN.F.8061), lateral view. Scale bars: A-C, 5 mm; B, 1 mm.
FIG. 3. — A-E in Icacinaceae fossil fruits from three sites of the Paris Basin (early Eocene, France): local diversity and global biogeographic implications
FIG. 3. — A-E, Iodes tubulifera Del Rio, Thomas & De Franceschi (MNHN.F.44738): A, lateral view of an endocarp showing the reticulum pattern of sharp ridges; B, dorsal view showing the keel; C, lateral view of second face of the endocarp; D, apical view showing the small pair of horns (arrows); E, basal view. F-I, MNHN.F.44740; F, lateral view of the endocarp showing the reticulum pattern of sharp ridges; G, SEM view of the endocarp wall units and ridges in transversal section; H, SEM view of tubular papillae; I, same with magnification. Scale bars: A-F, 5 mm; G-H, 500 µm; I, 30 µm.
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Annotated Behaviour and Observability Dataset (ABODe)
ABODe is a University of Edinburgh DataShare dataset for behavior classification in group-housed mice using home-cage video, identities, bounding boxes, ground-plate positions, and annotator labels.
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International Brain Laboratory public data
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