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Datos del estudio "Generación de red hidrográfica densa de República Dominicana a partir de modelo digital de elevaciones de resolución media"

<p><strong>Datos para el manuscrito &ldquo;Generaci&oacute;n de red hidrogr&aacute;fica densa de Rep&uacute;blica Dominicana a partir de modelo digital de elevaciones de resoluci&oacute;n media&rdquo;</strong></p> <p>Jos&eacute; Ram&oacute;n Mart&iacute;nez Batlle, Universidad Aut&oacute;noma de Santo Domingo (UASD) jmartinez19@uasd.edu.do</p> <p>Michela Izzo Gioiosa, Guakia Ambiente, michela.izzo@guakiambiente.org</p> <p>Este repositorio contiene datos geoespaciales resultantes de ejecutar el c&oacute;digo reproducible de R y GRASS GIS del <a href="https://github.com/geofis/red-hidrografica-densa-rd">repositorio de GitHub asociado</a>, como apoyo al manuscrito contenido en dicho repo.</p> <p>Los datos se distribuyen en dos archivos ZIP comprimidos, los cuales pueden descargarse de forma separada desde Zenodo.</p> <p>Archivo <code>gpkg-shp.zip</code>.</p> <p>Este comprimido contiene versiones en formato GeoPackage y ESRI-Shapefile (vectoriales) de los principales mapas generados en GRASS GIS. Constituye una alternativa r&aacute;pida para disponer de los datos hidrogr&aacute;ficos sin necesidad de abrir la base de datos de GRASS GIS, muy recomendado si s&oacute;lo se necesitan los productos hidrogr&aacute;ficos m&aacute;s importantes. Los archivos incluidos son los siguientes:</p> <ul> <li> <p><code>cursos_mas_largos*</code>: cursos m&aacute;s largos de 35 r&iacute;os seleccionados de la Rep&uacute;blica Dominicana basados en orden de red y representatividad territorial. Se priorizaron r&iacute;os de orden seis o superior. En &aacute;reas del sur y sudoeste, se incluyeron r&iacute;os de orden cinco de notable longitud.</p> </li> <li> <p><code>desembocaduras_rios_grandes*</code>: puntos de desembocaduras (<em>outlet</em>) de r&iacute;os grandes, seleccionados para extraerles sus cursos m&aacute;s largos.</p> </li> <li> <p><code>mascara.gpkg</code>: m&aacute;scara de visualizaci&oacute;n, la cual encierra el territorio dominicano limitado por sus costas y la frontera dom&iacute;nico-haitiana. Esta m&aacute;scara s&oacute;lo tiene fines de visualizaci&oacute;n, pues los an&aacute;lisis de hecho se realizaron empleando una m&aacute;scara ligeramente m&aacute;s grande, expandida aproximadamente 1 km hacia el oeste en la frontera.</p> </li> <li> <p><code>rstream_cuencas_strahler_terminal_umbral_540_todos_cleaned</code>: cuencas hidrogr&aacute;ficas exorreicas (cuya red desemboca en en el mar) de Rep&uacute;blica Dominicana delimitadas en forma de pol&iacute;gonos, generadas para un umbral de acumulaci&oacute;n de 540 celdas (aproximadamente 8 hect&aacute;reas), con indicaci&oacute;n del orden de red de Strahler m&aacute;ximo de la cuenca y el &aacute;rea en metros cuadrados.</p> </li> <li> <p><code>rstream_cuencas_strahler_umbral_540_orden_*</code>: representaciones de las cuencas seg&uacute;n &oacute;rdenes de red de Strahler para el umbral de acumulaci&oacute;n de 540 celdas (aproximadamente 8 hect&aacute;reas), tanto las cuencas terminales (exorreicas) como las que cuya red desemboca en lagos interiores o en otros r&iacute;os, extra&iacute;das con el complemento <code>r.stream.basins</code>.</p> </li> <li> <p>Archivos <code>rstream_orden_de_red_umbral_540_cleaned*</code>: red de drenaje de Rep&uacute;blica Dominicana, generada para un umbral de acumulaci&oacute;n de 540 celdas (aproximadamente 8 hect&aacute;reas), incluyendo los siguientes campos:</p> <ul> <li> <p><code>cat</code> entero: categor&iacute;a;</p> </li> <li> <p><code>stream</code> entero: n&uacute;mero de corriente, usualmente igual a cat;</p> </li> <li> <p><code>next_stream</code> entero: corriente a la que contribuye la corriente actual (aguas abajo);</p> </li> <li> <p><code>prev_streams</code>; dos o m&aacute;s corrientes contribuyentes (aguas arriba);</p> </li> <li> <p><code>strahler</code> entero: Orden de corriente de Strahler;</p> </li> <li> <p><code>horton</code> entero: Orden de corriente de Horton;</p> </li> <li> <p><code>shreve</code> entero: Magnitud de corriente de Shreve;</p> </li> <li> <p><code>hack</code> entero: Corrientes principales de Hack o orden de Gravelius;</p> </li> <li> <p><code>topo_dim</code> entero: Orden topol&oacute;gico de corrientes;</p> </li> <li> <p><code>scheidegger</code> entero: Enteros Asociados Consistentes de Scheidegger;</p> </li> <li> <p><code>drwal</code> entero: Jerarqu&iacute;a de corrientes de Drwal;</p> </li> <li> <p><code>length</code> precisi&oacute;n doble: longitud de la corriente;</p> </li> <li> <p><code>stright</code> precisi&oacute;n doble: longitud de la corriente como l&iacute;nea recta;</p> </li> <li> <p><code>sinusoid</code> precisi&oacute;n doble: dimensi&oacute;n fractal: longitud de la corriente/longitud de la corriente recta;</p> </li> <li> <p><code>cum_length</code> precisi&oacute;n doble: longitud de la corriente desde la fuente;</p> </li> <li> <p><code>flow_accum</code> precisi&oacute;n doble:</p> </li> <li> <p><code>out_dist</code> precisi&oacute;n doble: distancia desde el inicio de la corriente actual hasta la salida;</p> </li> <li> <p><code>source_elev</code> precisi&oacute;n doble: elevaci&oacute;n del inicio de la corriente;</p> </li> <li> <p><code>outlet_elev</code> precisi&oacute;n doble: elevaci&oacute;n de la salida de la corriente;</p> </li> <li> <p><code>elev_drop</code> precisi&oacute;n doble: diferencia entre source_elev y outlet_elev + ca&iacute;da de la salida;</p> </li> <li> <p><code>out_drop</code> precisi&oacute;n doble: ca&iacute;da en la salida de la corriente;</p> </li> <li> <p><code>gradient</code> precisi&oacute;n doble: ca&iacute;da/longitud;</p> </li> </ul> </li> </ul> <p>Archivos <code>grassdata##</code>.</p> <p>Estos archivos son las 17 partes de un archivo ZIP (<code>##</code> son n&uacute;meros del 00 al 16), las cuales, al concatenarse, producir&aacute;n un &uacute;nico ZIP conteniendo la base de datos exhaustiva de GRASS GIS (ver instrucciones de concatenaci&oacute;n en el siguiente apartado). Esta base de datos incluye todos los mapas del flujo de trabajo &iacute;ntegro, que incluye los subproductos generados desde el preprocesamiento del DEM, hasta las salidas obtenidas por hidrolog&iacute;a computacional. Las fuentes r&aacute;ster tienen resoluci&oacute;n m&aacute;xima de 12.5 metros, y la extensi&oacute;n m&aacute;xima de la base de datos tiene los siguientes l&iacute;mites en el sistema WGS 84 / UTM zone 19N: norte 2214300, sur 1919000, oeste 180300, este 580700. Por su gran tama&ntilde;o, se recomienda usar esta base de datos s&oacute;lo para fines de reproducibilidad. Se recomienda abrir esta base de datos con GRASS GIS directamente o, alternativamente, a trav&eacute;s de QGIS. Los mapas m&aacute;s relevantes son los siguientes:</p> <ul> <li> <p><code>areas_prospeccion_###_km2</code> vectoriales: un &aacute;rea encerrada por un c&iacute;rculo imaginario de superficie <code>###</code> kil&oacute;metros cuadrados, que rodea a una estaci&oacute;n meteoclim&aacute;tica existente o propuesta, creado con el objetivo de evaluar, de manera flexible, la idoneidad de instalar una estaci&oacute;n hidrom&eacute;trica. El mapa <code>areas_prospeccion_todas</code> las re&uacute;ne a todas con independencia de su tama&ntilde;o superficial.</p> </li> <li> <p><code>buffers</code> vectorial: &aacute;reas de influencia en torno a tramos de r&iacute;o id&oacute;neos para monitoreo por estaci&oacute;n hidrom&eacute;trica.</p> </li> <li> <p><code>calizas_con_depresiones</code> vectorial y r&aacute;ster: &aacute;reas de calizas con depresiones delimitadas a partir del Mapa Geol&oacute;gico de Rep&uacute;blica Dominicana escala 1:250,000.</p> </li> <li> <p><code>dem*</code> r&aacute;sters: el modelo digital de elevaciones en todas sus versiones a lo largo del preprocesamiento, desde el original (<code>dem</code>), hasta el tallado (<code>dem_tallado</code>).</p> </li> <li> <p><code>depresiones*</code> vectorial y r&aacute;sters: delimitaci&oacute;n manual y asistida&mdash;con el complemento <code>r.geomorphon</code> de GRASS GIS&mdash;de las depresiones detectadas en &aacute;reas con calizas.</p> </li> <li> <p><code>egm2008_*</code> r&aacute;sters: altura de geoide de La Espa&ntilde;ola a 1 arco-minuto de resoluci&oacute;n espacial (original EGM2008), e interpolado a 50 m.</p> </li> <li> <p><code>escenario_###_km2</code> vectoriales: distribuci&oacute;n de puntos de estaciones meteoclim&aacute;ticas propuestas en el estudio complementario titulado &ldquo;Selecci&oacute;n de sitios para el establecimiento de una red de estaciones meteoclim&aacute;ticas en Rep&uacute;blica Dominicana usando decisi&oacute;n multicriterio y an&aacute;lisis de vecindad&rdquo;, donde <code>###</code> son las densidades de 100, 150 y 250 kil&oacute;metros cuadrados por estaci&oacute;n.</p> </li> <li> <p><code>estaciones_*</code> vectoriales: estaciones meteoclim&aacute;ticas, en estado &ldquo;bueno&rdquo;, de INDRHI y ONAMET.</p> </li> <li> <p><code>geomorfonos</code> r&aacute;ster: mapa de geom&oacute;rfonos de Rep&uacute;blica Dominicana, derivado del DEM pseudo-ortom&eacute;trico usando el complemento <code>r.geomorphon</code> de GRASS GIS.</p> </li> <li> <p><code>litologia_recodificado</code> r&aacute;ster y vectorial: pol&iacute;gonos de las litolog&iacute;as extra&iacute;dos del Mapa Geol&oacute;gico de Rep&uacute;blica Dominicana, escala 1:250,000.</p> </li> <li> <p><code>mascara*</code> vectoriales: m&aacute;scaras de pa&iacute;s, que incluye la m&aacute;scara por defecto, con &aacute;rea <em>buffer</em> de 1 km, y con &aacute;rea <em>buffer</em> de 1 km s&oacute;lo en la frontera.</p> </li> <li> <p><code>prioridad*</code> vectoriales y rasters: prioridad, original y reescalada, a nivel global y para cada escenario de densidad, de instalacion de estaciones hidrometricas.</p> </li> <li> <p><code>puntos_para_areas_prospeccion_###_km2</code> vectoriales: Mapas de puntos conteniendo los centroides de las &aacute;reas de prospecci&oacute;n para el establecimiento de estaciones hidrom&eacute;tricas.</p> </li> <li> <p><code>red_mtn50k_cleaned</code> vectorial: red de drenaje, aparentemente extra&iacute;da desde el mapa topogr&aacute;fico nacioanal escala 1:50,000. No usada en el estudio, almacenada para fines de consultas posteriores. El sufijo &ldquo;cleaned&rdquo; hace referencia a que se aplic&oacute; una correcci&oacute;n de topolog&iacute;a mediante la herramienta <code>v.clean</code> de GRASS GIS.</p> </li> <li> <p><code>red_mtn50k_cleaned_largos</code> vectorial y r&aacute;ster: red de cursos largos usada para el tallado del DEM. Esta red se compone de una selecci&oacute;n de r&iacute;os largos y permanentes, extra&iacute;dos desde im&aacute;genes satelitales (Google; Airbus, CNES; Airbus, Landsat; Copernicus; Maxar Technologies; U.S. Geological Survey, 2023), el mapa topogr&aacute;fico nacional escala 1:50,000 (Instituto Cartogr&aacute;fico Militar (ICM), 1989) y OpenStreetMap contributors (2017). Los r&iacute;os que llenan embalses, se representan mediante trazados hist&oacute;ricos para as&iacute; mantener la continuidad hidrol&oacute;gica.</p> </li> <li> <p><code>rstream_cuencas_strahler_*</code> vectoriales y r&aacute;sters: representaciones de las cuencas seg&uacute;n &oacute;rdenes de red de Strahler y umbrales de acumulaci&oacute;n (180, 540 y 900 celdas), tanto las cuencas terminales (exorreicas) como las que cuya red desemboca en lagos interiores o en otros r&iacute;os, extra&iacute;das con el complemento <code>r.stream.basins</code>. Los archivos que no incluyen indicaci&oacute;n de <code>orden</code>, y en su lugar aparece la palabra <code>todos</code>, contienen una relaci&oacute;n exhausitva de todas las cuencas para el umbral en cuesti&oacute;n.</p> </li> <li> <p><code>rstream_direccion_umbral_*</code> r&aacute;sters: direcci&oacute;n de flujo de cada umbral de acumulaci&oacute;n (180, 540 y 900 celdas).</p> </li> <li> <p><code>rstream_orden_de_red_umbral_*</code> y <code>rstream_orden_strahler_*</code> r&aacute;sters y vectoriales: red de <em>talwegs</em> segregadas en funci&oacute;n del orden de red de Strahler y del umbral de acumulaci&oacute;n. Cuando no se especifica <code>orden</code> (e.g.&nbsp;rstream<em>orden_de_red_umbral</em>*`), se trata de un vectorial que incluye todos los &oacute;rdenes de forma comprehensiva.</p> </li> <li> <p><code>rstream_orden_horton_*</code> r&aacute;sters: red de <em>talwegs</em> seg&uacute;n orden de jerarqu&iacute;a de Horton y umbrales de acumulaci&oacute;n de 180, 540 y 900 celdas.</p> </li> <li> <p><code>rstream_talwegs_umbral_*</code> rasters y vectoriales: red <em>talwegs</em> seg&uacute;n umbrales de acumulaci&oacute;n de 180, 540 y 900 celdas, obtenidos mediante el complemento <code>r.stream.extract</code>.</p> </li> <li> <p><code>rvb_fondo_de_valle_pais</code> r&aacute;ster: &ldquo;&iacute;ndice m&uacute;ltiresoluci&oacute;n de planitud de fondos de valle&rdquo; MrVBF, obtenido mediante el complemento <code>r.valley.bottom</code>.</p> </li> <li> <p><code>rwshed_acum</code> r&aacute;ster: mapa de acumulaci&oacute;n de flujo obtenido a trav&eacute;s del complemento <code>r.watershed</code>.</p> </li> <li> <p><code>topologia_orden*</code> r&aacute;sters: dimensi&oacute;n topol&oacute;gica de los cursos obtenida por medio del complemento <code>r.stream.order</code>.</p> </li> </ul> <p>Instrucciones para concatenar las partes ZIP de la base de datos de GRASS GIS</p> <p>La base de datos de GRASS GIS est&aacute; comprimida un archivo ZIP que hemos tenido que segmentar en peque&ntilde;as partes para facilitar la subida a Zenodo. Los archivos <code>grassdata##</code>, donde <code>##</code> corresponden a los n&uacute;meros del 00 al 16, son las 17 partes de un archivo ZIP. Si concatenas las partes obtendr&aacute;s un ZIP &uacute;nico que podr&aacute;s descomprimir para acceder a la base de datos exhaustiva de GRASS GIS. A continuaci&oacute;n te explicamos c&oacute;mo hacer la concatenaci&oacute;n, tanto en Linux como en Windows.</p> <p>Concatenar en Linux</p> <p>Coloca todas las partes <code>grassdata##</code> en un directorio vac&iacute;o. Desde la terminal, en dicho direcotiro, usa el siguiente comando:</p> <pre><code>cat grassdata* &gt; grassdata.zip</code></pre> <p>Concatenar en Windows</p> <ul> <li> <p>En el s&iacute;mbolo de sistema (<em>command prompt</em>), con el comando <code>copy</code>:</p> </li> </ul> <pre><code>copy /b grassdata00+grassdata01+...+grassdata16 grassdata.zip</code></pre> <p>Reemplaza <code>...</code> con el resto de tus archivos en orden. Por ejemplo, <code>grassdata00+grassdata01+grassdata02+grassdata03+grassdata04+<br> grassdata05+grassdata06+grassdata07+grassdata08+grassdata09+<br> grassdata10+grassdata11+grassdata12+grassdata13+grassdata14+<br> grassdata15+grassdata16</code></p> <ul> <li> <p>En la interfaz gr&aacute;fica (GUI), usando 7-Zip</p> <ul> <li> <p>Si a&uacute;n no tienes 7-Zip instalado, puedes descargarlo desde <a href="https://www.7-zip.org/">su sitio web oficial</a>.</p> </li> <li> <p>Instala el programa como cualquier otro software en Windows.</p> </li> <li> <p>Ubica los archivos divididos en una carpeta.</p> </li> <li> <p>Haz clic derecho en el primer archivo de la serie (<code>grassdata00</code>).</p> </li> <li> <p>En el men&uacute; contextual, pasa el cursor sobre &ldquo;7-Zip&rdquo; y selecciona &ldquo;Extraer aqu&iacute;&rdquo; o &ldquo;Extraer en grassdata.zip&rdquo;.</p> </li> </ul> </li> </ul> <p>Si los archivos est&aacute;n correctamente secuenciados, 7-Zip los unir&aacute; autom&aacute;ticamente y extraer&aacute; el archivo original.</p> <ul> <li> <p>Otras herramientas de GUI:</p> <ul> <li> <p><strong>HJSplit</strong>: Es una aplicaci&oacute;n gratuita que permite dividir y unir archivos. Tiene versiones tanto para Windows como para otros sistemas operativos.</p> </li> <li> <p><strong>File Splitter and Joiner</strong>: Es otra aplicaci&oacute;n gratuita para Windows que permite dividir archivos grandes en peque&ntilde;as porciones y luego unirlas.</p> </li> </ul> </li> </ul>

opencc-by-4.0Jul 2023View details →
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Figure 1. – Bodianus rubrisos. A in Record of Bodianus rubrisos Gomon, 2006 from the northern Red Sea, previously misidentified as B. leucosticticus (non Bennett) or B. trilineatus (non Fowler) (Labridae)

Figure 1. – Bodianus rubrisos. A: HUJ 13667, male, 190.6 mm SL, Eilat, Gulf of Aqaba, Red Sea, 200 m depth. Photograph Arik Diamant; B: HUJ 20530, female, 172.3 mm SL, Eilat, Gulf of Aqaba, Red Sea, 200-300 m depth. Photograph Daniel Golani.

opencc-by-4.0Dec 2016View details →
zenodo40/100

Figure 2 in Record of Bodianus rubrisos Gomon, 2006 from the northern Red Sea, previously misidentified as B. leucosticticus (non Bennett) or B. trilineatus (non Fowler) (Labridae)

Figure 2. – Geographical distribution of the subgenus Bodianus (Peneverreo). A: B. leucosticticus; B: B. paraleucosticticus; C: B. rubrisos; D: B. trilineatus.

opencc-by-4.0Dec 2016View details →
zenodo40/100

Rosa noisettiana Red. (BR0000005407828)

Belgium Herbarium image of <a href="https://www.plantentuinmeise.be">Meise Botanic Garden</a>.

opencc-by-sa-4.0May 2019View details →
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Data from: Beaver activity and red squirrel presence predict bird assemblages in boreal Canada

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publicJan 2023View details →
dryad40/100

Data from: Insights from a 31-year study demonstrate an inverse correlation between recreational activities and red deer fecundity, with body weight as a mediator

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publicApr 2024View details →
dryad40/100

Data from: Ornamentation is associated with social costs in male red-backed fairywrens (<em>Malurus melanocephalus</em>)

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publicNov 2025View details →
dryad40/100

Data from: Mesophotic Foraminiferal-Algal Nodules play a role in the Red Sea carbonate budget

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publicAug 2023View details →
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Red-green opponency in the long visual fibre photoreceptors of brushfoot butterflies (Nymphalidae)

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publicSep 2021View details →
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Data from: Among-individual behavioural variation in the ornamental red cherry shrimp, Neocaridina heteropoda

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publicFeb 2024View details →
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Data for: Red foxes enhance long-term tree growth near the Arctic treeline

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publicJul 2022View details →
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Red-footed and masked boobies stable isotope data

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publicMar 2024View details →
dryad40/100

Data from: Dynamics of diet-egg transfer of fatty acids in the teleost fish, red drum (Sciaenops ocellatus)

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publicAug 2020View details →
dryad40/100

Source code for R tutorials and dataset for empirical case study on Malurus elegans (red-winged fairy wren)

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publicJul 2021View details →
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Data from: A multifaceted ecological assessment reveals the invasion of the freshwater red macroalga Montagnia macrospora (Batrachospermales, Rhodophyta) in Taiwan

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publicMay 2024View details →
dryad40/100

Red vision in animals is broadly associated with lighting environment but not types of visual task

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publicJan 2024View details →
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Multiple drivers of spring migration timing for red deer over the past 16 years in northern Europe

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publicNov 2024View details →
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Data from: Variation in nuptial colour in relation to sex, individual quality and mating success in the sex-role reversed red phalarope (Phalaropus fulicarius)

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publicApr 2024View details →
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Seasonal but not sex-biased gene expression of the carotenoid ketolase, CYP2J19, in the sexually dichromatic southern red bishop (Euplectes orix)

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publicAug 2022View details →
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Data from: Evaluating staging habitat quality to advance the conservation of a declining migratory shorebird, Red Knot Calidris canutus

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publicMay 2022View details →

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Annotated Behaviour and Observability Dataset (ABODe)

ABODe is a University of Edinburgh DataShare dataset for behavior classification in group-housed mice using home-cage video, identities, bounding boxes, ground-plate positions, and annotator labels.

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