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59 results for “Hif1α”
POTENCIALES CIRCUITOS REGULATORIOS ENTRE miRNAs, MITF Y HIF1α EN LA LÍNEA CELULAR DE MELANOMA B16 BAJO CONDICIONES DE SUPRESIÓN DE CRECIMIENTO CELULAR E HIPOPIGMENTACIÓN INDUCIDOS.
<p>El melanoma es un cáncer de melanocitos, células especializadas en la síntesis de melanina, que muestra variación en la expresión de moléculas como RNAs mensajeros (mRNAs), factores de transcripción y microRNAs (miRNAs), entre otras. Los miRNAs son RNAs pequeños no codificantes entre los 18-22 nt, asociados con la regulación de cerca del 30% de los genes que codifican para proteínas, incluidos factores de transcripción, tanto en condiciones fisiológicas, como fisiopatológicas. A su vez, los factores de transcripción regulan la expresión de cientos de genes, incluidos los miRNAs; sin embargo, a la fecha, la asociación funcional entre estos tres actores moleculares y el fenotipo tumoral no es del todo clara. El objetivo de la presente investigación fue evaluar la expresión de miRNAs y de los mRNAs de los factores de transcripción Mitf y Hif1α en la línea celular de melanoma B16F1 expuesta a la 5-bromo-2´-deoxiuridina (5-Br-2’-dU), y plantear potenciales circuitos regulatorios asociados al fenotipo de hipopigmentación y disminución de la proliferación celular. Para ello, células B16F1 fueron expuestas a 5-Br-2’-dU 2.5 µg.mL-1 durante 72 horas, en medio DMEM (Dulbecco Modified Eagle Medium) a 37°C y 5% de CO2. Mediante small RNAseq se determinó la expresión diferencial de miRNAs maduros, mientras que la predicción de sus blancos moleculares, Mitf y Hif1α se realizó por TargetScanMouse versión 7.2. La expresión fue confirmada para los miRNAs miR-211-5p, miR-138-5p, miR-129-5p, miR-470-5p y miR-470-3p por RT-qPCR stem loop con un N= 3 y establecida para Mitf y Hif1α por RT-qPCR con un N=4; en todos los casos, el nivel de significación (*) fue determinado mediante una prueba t-Student a dos colas con corrección del Welch y las diferencias fueron consideradas como estadísticamente significativas para un valor p <0.05, ns: no significativo. Usando DEseq2, se analizaron los conteos obtenidos por small RNAseq y se determinó la expresión diferencial de 33 miRNAs por exposición a 5-Br-2’-dU, 11 sobre-expresados y 21 sub-expresados. Se confirmó por RT-qPCR el nivel de expresión de cinco miRNAs, dos de ellos a la baja (miR-211-5p (2.2X) y 138-5p (2.8X) y tres al alta (miR-129-5p (1.5X), miR-470-5p (22.7X) y miR-470-3p (124X)). El nivel de expresión de los mRNAs Mitf y Hif1α, se encontró para ambos a la baja (3.48X y, 4.58X, respectivamente). El análisis bioinformático por TargetScanMouse facilitó la construcción de potenciales circuitos regulatorios entre los miRNAs diferencialmente expresados y los factores Mitf y Hif1α para el fenotipo de hipopigmentación y disminución de la proliferación celular inducidos por la 5-Br-2’-dU. Los resultados obtenidos, plantean nuevos escenarios en el estudio del melanoma y mejoran nuestra comprensión de las potenciales asociaciones funcionales entre conjuntos de miRNAs, factores de transcripción como MITF y HIF1α y algunos genes que participan en el control de la pigmentación y la proliferación celular; sin embargo, se requiere establecer mediante ensayos de gen reportero de la luciferasa y otros ensayos funcionales, donde se usen estrategias como miRNAs miméticos y antimiRs, si para los circuitos regulatorios planteados, existe asociación funcional.</p>
Effect of fecal microbiota transplantation on diabetic wound healing through the IL-17A-mTOR-HIF1α signaling axis
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Data from: HIF1α gates tendon response to overload and drives tendinopathy independently of vascular recruitment
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Gene expression signature of WT siblings and hif1α mutants in normoxia and after hypoxia chamber incubation
GEO Series GSE89117. Danio rerio. 4 samples. Type: Expression profiling by array.
RNA levels in wild-type and HIF1α-mutant MCF7 cells in normoxia (21% O2), and in hypoxia (1% O2) for 3 h or 24 h
GEO Series GSE122059. Homo sapiens. 18 samples. Type: Expression profiling by high throughput sequencing.
A functional map of genomic HIF1α-DNA complexes in the eye lens revealed through multiomics analysis [RNA-seq]
GEO Series GSE166632. Gallus gallus. 6 samples. Type: Expression profiling by high throughput sequencing.
HIF1α Mediates Circadian Regulation of Skeletal Muscle Metabolism and Substrate Preference in Response to Time-of-Day Exercise
GEO Series GSE282641. Mus musculus. 64 samples. Type: Expression profiling by high throughput sequencing.
m6A methylation regulates hypoxia-induced pancreatic cancer glycolytic metabolism through ALKBH5-HDAC4-HIF1α positive feedback loop
GEO Series GSE218546. Homo sapiens. 6 samples. Type: Expression profiling by high throughput sequencing.
Melanoma bone metastasis-induced osteocyte ferroptosis via the HIF1α-HMOX1 axis.
GEO Series GSE276370. Mus musculus. 15 samples. Type: Expression profiling by high throughput sequencing.
Pseudohypoxic stabilization of HIF1α via suppression of cyclophilin D promotes metastasis of melanoma
GEO Series GSE299396. Mus musculus. 8 samples. Type: Expression profiling by high throughput sequencing.
Tissue origin of endothelial cells determines immune system modulation and regulation of HIF1α-, TGFβ- and VEGF- signaling
GEO Series GSE254272. Mus musculus. 9 samples. Type: Expression profiling by high throughput sequencing.
HIF1α Regulates Early Metabolic Changes Due to Activation of Innate Immunity in Nuclear Reprogramming
GEO Series GSE142217. Homo sapiens. 4 samples. Type: Expression profiling by high throughput sequencing.
Nrf2 and HIF1α merge to arsenic-induced metabolic reprogramming and formation of the cancer stem-like cells.
GEO Series GSE145834. Homo sapiens. 5 samples. Type: Genome binding/occupancy profiling by high throughput sequencing.
FNDC4 alleviates cardiac ischemia/reperfusion injury through facilitating HIF1α-dependent cardiomyocyte survival and angiogenesis in male mice
GEO Series GSE277729. Mus musculus. 6 samples. Type: Expression profiling by high throughput sequencing.
Opposing Effects of HIF1α and HIF2α on Chromaffin Cell Phenotypic Features and Tumor Cell Proliferation: Insights from MAX [human]
GEO Series GSE51081. Homo sapiens. 9 samples. Type: Expression profiling by array.
Opposing Effects of HIF1α and HIF2α on Chromaffin Cell Phenotypic Features and Tumor Cell Proliferation: Insights from MAX
GEO Series GSE51087. Rattus norvegicus; Homo sapiens. 13 samples. Type: Expression profiling by array.
Melanoma bone metastasis-induced osteocyte ferroptosis via the HIF1α-HMOX1 axis II
GEO Series GSE276373. Mus musculus. 6 samples. Type: Expression profiling by high throughput sequencing.
HIF1α deletion promotes mitochondrial repurposing in bone marrow-derived macrophages, but not in tissue-resident alveolar macrophages
GEO Series GSE279117. Mus musculus. 24 samples. Type: Expression profiling by high throughput sequencing.
HIF1α gates tendon response to overload and drives tendinopathy independently from vascular recruitment
GEO Series GSE276425. Mus musculus. 16 samples. Type: Expression profiling by high throughput sequencing.
HIF1α-glycolysis engages activation-induced cell death to drive IFN-γ induction in hypoxic T cells
GEO Series GSE253090. Mus musculus. 20 samples. Type: Expression profiling by high throughput sequencing; Genome binding/occupancy profiling by high throughput sequencing.
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Allen Brain Atlas is an Allen Institute collection of brain map atlases, datasets, APIs, and analysis tools covering mouse, human, and non-human primate brain resources.
Annotated Behaviour and Observability Dataset (ABODe)
ABODe is a University of Edinburgh DataShare dataset for behavior classification in group-housed mice using home-cage video, identities, bounding boxes, ground-plate positions, and annotator labels.
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The International Brain Laboratory public data releases expose standardized mouse decision-making experiments, including Neuropixels recordings, widefield calcium imaging, behavior, and session metadata accessed through the ONE API.
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