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O "viaduto da controvérsia" em Tucupi: uma reflexão sobre responsabilidade e transparência na administração pública
<p>NUMAO, F. H.; SOUZA, J. V. L. O.; OLIVEIRA, L. S.; MENDES, L. H. P.; RIBEIRO, M. A. de J. O Viaduto da Controvérsia em Tucupi: Uma Reflexão sobre Responsabilidade e Transparência na Administração Pública. <strong>Revista Tecnológica de Administração</strong>, Rio de Janeiro, v. 1, n. 2, p. 209-220, 2024. https://doi.org/10.12660/reta.v1n2.2024.91569</p>
Relatório Técnico - Vulnerabilidade e risco: análise do desastre socioambiental em Santa Maria - RS (2024)
<p><span>O presente estudo técnico é um dos produtos elaborados pelo Laboratório de Investigação Sociológica através do Projeto "Catástrofes climáticas: dimensões socioculturais do alerta e contenção de riscos" (Nº062294), contemplado no processo seletivo do Programa de Extensão “UFSM Solidária e Cidadã: esperança e reconstrução para o Rio Grande do Sul” e financiadas pela Pró-Reitoria de Extensão (PRE/UFSM). </span><span>Esta produção é fundamentada na noção de crise socioambiental, reconhecendo a agência humana e os riscos que emergem neste contexto. Com a proposta de fornecer uma análise sociológica do desastre socioambiental de 2024, com foco no município de Santa Maria,</span> <span>o trabalho busca servir de subsidio às ações preventivas e de reparação para cenários futuro. Desta forma, a pesquisa se alinhada diretamente com o Objetivo de Desenvolvimento Sustentável 13 (ODS 13) da Organização das Nações Unidas (ONU), que busca tomar medidas urgentes para combater a </span><span>mudança climática e seus impactos. </span><span>Para alcançar tal entendimento, foi desenvolvida uma análise histórica dos eventos climatológicos, hidrológicos e meteorológicos ocorridos nas últimas três décadas, abarcando os níveis nacional, estadual e municipal. Abordagem essa que permitiu compreender os fenômenos tanto numa escala macro (Brasil) quanto micro (Santa Maria e seus bairros). </span><span>Considerando a finalidade da pesquisa, na produção de indicadores que propiciem uma reflexão acerca dos processos de vulnerabilização ao risco de desastre ambiental, o estudo se concentrou especialmente em Santa Maria (RS). Por meio da transformação de dados censitários em mapas, foi possível traçar o perfil das populações atingidas pela tragédia. Assim, a proposta contribui também na orientação de uma gestão local mais eficaz, possibilitando uma melhor avaliação e gestão de riscos no município, servindo de orientação no desenvolvimento de políticas públicas para as áreas afetadas.</span></p>
Louhi EM test data
<p>This ZIP compressed distribution file contains the original data related to manuscript "Drone-based electromagnetic survey system for geophysical applications" by Markku Pirttijärvi, Ari Saartenoja & Pekka Korkeakangas submitted to Open Research Europe (https://open-research-europe.ec.europa.eu/) in June 2021. The data, presented as simple column formatted text files, are put into two folders, Lintumaansuo and Ervastinranta. Lintumaansuo contains data related to Figs. 11-14 of the manuscript. Ervastinranta contains data related to Figs. 15-17 of the manuscript. Extra data provide background maps and digital elevation models (copyright National Land Survey of Finland, 2020) for Lintumaansuo and Ervastinranta survey sites. The data in this distribution originated in Horizon 2020 project, NEXT - New Exploration Technologies (Grant Agreement No. 776804 — H2020-SC5-2017). For more detailed information about the data, please, refer to the Readme*.txt file included with the distribution.</p> <p> </p>
Relatórios de produção científica de pesquisadores e estudantes de grupos de pesquisa em Humanidades Digitais
<p>Relatório de produção científica de integrantes de grupos de pesquisa (do diretório de grupos do CNPq) cujo termo "Humanidades Digitais" aparece no título do grupo. Junto com o relatório há também grafos e dataset de relação de coautoria entre os integrantes.</p>
Lista dos alunos da AF_EE_EG_EM_1790_1940 (AHM)
<p>Este conjunto de dados resulta da transformação de uma base transcrita da "Lista dos alunos da Academia de Fortificação, Escola do Exército, Escola de Guerra e Escola Militar (1790-1940)", guardada no Arquivo Histórico Militar (AHM), e cuja actividade enquadra-se no âmbito da parceria realizada entre o projecto TECHNETEMPIRE - REDES TÉCNICO-CIENTÍFICAS NA FORMAÇÃO DO AMBIENTE CONSTRUÍDO NO IMPÉRIO PORTUGUÊS (1647-1871) e o ARQUIVO HISTÓRICO MILITAR</p> <p>A transcrição original foi entregue ao Arquivo Histórico militar a 05 de Fevereiro de 2021.</p> <p>Este conjunto de dados não corresponde a essa lista mas parte dela. No âmbito do projecto foram introduzidas algumas alterações, retirados campos, entre outras coisas para facilitar a análise. A base de dados que se publica agora é o resultado desse trabalho. é por isso a versão 2 da base.</p> <p>A versão 1 foi entregue ao Arquivo Histórico Militar. </p> <p>O trabalho de transcrição da fonte foi um trabalho realizado em colaboração com diversos voluntários. A autoria neste caso aponta para as responsáveis pela coordenação da actividade. </p> <p>Para mais informação sobre a actividade no âmbito da qual estes dados foram transcritos ver: https://technetempire.fcsh.unl.pt/en/2020-2/9000-on-tuesdays-transcription-marathon/</p> <table> <tbody> <tr> <td> </td> </tr> </tbody> </table>
Synthetic dataset used for validating MDSPACE method for analyzing continuous conformational variability of biomolecules in cryo-EM single particle images
<p>Synthetic dataset used for validating MDSPACE method for analyzing continuous conformational variability of biomolecules in cryo-EM single particle images. A README file with the contents of the dataset is included. </p>
Simulated water models with Apoferritin for use in cryo-EM image simulations with amorphous ice
<p>This dataset contains the atomic coordinates of several water models produced using the NAMD molecular dynamics software. The contents of each file is listed below.</p> <ul> <li><strong><em>water_81_coords.pdb</em></strong> - water only in a cubic box with side length 81A</li> <li><strong><em>water_243_coords.pdb</em></strong> - water only in a cubic box with side length 243A</li> <li><strong><em>water_486_coords.pdb</em></strong> - water only in a cubic box with side length 486A</li> <li><strong>water_567_coords.pdb</strong> - water only in a cubic box with side length 567A</li> <li><strong><em>water_645_coords.pdb</em></strong> - water only in a cubic box with side length 645A</li> <li><strong><em>water_735_coords.pdb</em></strong> - water only in a cubic box with side length 735A</li> <li><strong><em>apo_water_723_coords.pdb</em></strong> - water and apoferritin in a cubic box with side length 723A where apoferritin atoms are constrained</li> </ul>
ipaast case study: Wiltshire yield and EM survey data
<p>These data were collected by Soyl Ltd as part of a commercial agricultural soil survey. They were reprocessed by the University of Ghent ipaast team. </p>
Critérios ou Convenções de Alinhamento do Grego às Traduções em Português
<p>This dataset contains guidelines and a gold standard for the alignment of Ancient Greek texts with Portuguese translations.</p> <p>The Corpus and Annotation Style Guide are aligned and adapted from the Ancient Greek to English Guidelines (Chiara Palladino, & Farnoosh Shamsian. (2022). Translation Alignment: Ancient Greek to English. Annotation Style Guide and Gold Standard. (1.0) [Data set]. Zenodo. <a href="https://doi.org/10.5281/zenodo.7362097">https://doi.org/10.5281/zenodo.7362097</a>). The alignment was performed by two domain experts using Ugarit (https://ugarit.ialigner.com/). </p> <p>The Guidelines and Gold Standard can be used to perform and evaluate alignments of various texts in Ancient Greek, to create other datasets, or to train automated translation alignment models. </p> <p>For further information on Ugarit and translation alignment of historical languages, see https://ugarit.ialigner.com/bib.php and follow us on Twitter (@ugarit_ty). </p> <p> </p>
LocScale-EMmerNet deep learning models for contrast optimisation of cryo-EM maps
<p>EMmerNet deep learning models for local optimisation of cryo-EM map contrast using <a href="https://gitlab.tudelft.nl/aj-lab/locscale">LocScale</a>.</p>
Dados brutos: "Competência em informação: padrões do tempo de aceite de artigos indexados na BRAPCI"
<p>Esse conjunto de dados sustenta os resultados e as conclusões do estudo: LIMA, Luis Fernando Maia; DE LUCCA, Djuli Machado; LEITE, Cassiane Macedo. Competência em informação: padrões do tempo de aceite de artigos indexados na BRAPCI. Encontros Bibli, Florianópolis, v. 28, e. 94373, 2023. Disponível em: https://doi.org/10.5007/1518-2924.2023.e94373. Acesso em: 03 out. 2023. </p> <p>Resumo do artigo: Objetiva analisar aspectos relacionados ao tempo de aceite dos artigos brasileiros que contemplam a competência em informação indexados na base BRAPCI, indicando evolução temporal, padrões medianos de tempo de aceite, periódicos e a relação entre tempos de aceite e qualidade dos periódicos. Trata-se de análise estatística relacionada ao período entre a submissão e aprovação de artigos científicos originais brasileiros indexados na base BRAPCI entre os anos de 2000 a 2019, a partir de estratégia de busca que contempla os termos ‘competência em informação’ e seus sinônimos na literatura científica em Ciência da Informação. Foram úteis para a investigação um conjunto de 177 artigos publicados entre 2004 e 2019, sendo a maioria deles com tempo de aceite aceitável e esperado, conforme parâmetros levantados na literatura. Há, ainda, uniformidade da distribuição anual dos tempos de aceite entre os anos de 2014 e 2018. Os resultados evidenciam que não há relação entre a qualidade do periódico e tempos mais curtos de aceite. É possível observar, pelo menos a partir dos resultados levantados nesta investigação, que o tempo de aceite é um elemento favorável no processo de comunicação científica da temática de competência em informação no Brasil e pode, como consequência, constituir-se como um fator contribuidor para o desenvolvimento da temática em âmbito social, na ocasião em que os resultados das investigações são celeremente divulgados à sociedade. <strong>PALAVRAS-CHAVE:</strong> Tempo de aceite; Comunicação Científica; Competência em informação; Produção científica.</p>
Pós-humanismo e pós-humano: revisão sistemática em bases científicas
<p>Dados provenientes das bases: Web of Science, Scopus, Scielo, Library, Information Science and Technology Abstracts (LISTA), Information Science and Technology Abstracts (ISTA), Emerald, Base de Dados Referencial de Artigos de Periódicos em Ciência da Informação (BRAPCI) e Base do Encontro Nacional de Pesquisa em Ciência da Informação (BENANCIB), cuja seleção foi realizada no período entre 28 de março a 07 de abril de 2020 pelos pesquisadores Profa. Ma. Adelaide Helena Targino Casimiro e Prof. Dr. Wagner Junqueira de Araújo.</p> <p>Data from the databases: Web of Science, Scopus, Scielo, Library, Information Science and Technology Abstracts (LISTA), Information Science and Technology Abstracts (ISTA), Emerald, Base de Dados Referencial de Artigos de Periódicos em Ciência da Informação (BRAPCI) e Base do Encontro Nacional de Pesquisa em Ciência da Informação (BENANCIB), whose selection was carried out between March 28 to April 7, 2020 by researchers professor Adelaide Helena Targino Casimiro and professor Wagner Junqueira de Araújo.</p>
Vídeo 5_ Barragens de Rejeiros em Minas Gerais: números alarmantes
<p>Este vídeo integra a Disciplina Controvérsias Sociocientíficas e Território: barragens de rejeitos. Unidade 3: Território, barragens e mapeamento. Mestrado Profissional em Ensino em Biologia (PROFBIO). Universidade Federal de Minas Gerais. Belo Horizonte, 2020. Este é o 5º vídeo de uma sequência de 6 vídeos. https://www.youtube.com/watch?v=BtNpXppZWyk&t=418s</p> <p> </p> <p> </p>
Screen captures illustrating and depicting EM densities of the ACE2 (PDB ID 6CS2) model
<p>Depicting of cryo-EM density maps using the provided python script option of the first example of our paper (see links). The lack of sufficient density for a few of the outer loops is quite obvious from these images.</p>
Como calcular a quantidade de proteína/DNA em uma banda com o ImageJ
<p>Esse vídeo é sobre como realizar análise de densitometria utilizando o ImageJ.</p> <p>Link no youtube: https://www.youtube.com/watch?v=NJO0CLwwpmw</p> <p> </p> <p><strong>Info:</strong></p> <p>Lingua: Português</p> <p>Programa: FIJI - Fiji is just ImageJ</p> <p>Imagem gel utilizada:</p> <ul> <li> File: SDS-PAGE with Taq DNA Polymerase.JPG</li> <li>Author: Marta Ferreira (MPCF)</li> <li>Multi-licensed under the GFDL and all CC-By-SA</li> <li>Link: https://commons.wikimedia.org/wiki/File:SDS-PAGE_with_Taq_DNA_Polymerase.JPG</li> </ul> <p>Imagem gel artificial</p> <ul> <li>File: Fake_gel.png</li> <li>Author: Molino, JVD</li> <li>Made in: Inkscape</li> </ul>
Code outputs and figures from "Efficient high-resolution refinement in cryo-EM with stochastic gradient descent"
<p>Code outputs and figures for the numerical experiments on preconditioned SGD for cryo-EM reconstruction for reproducing the results in the article:</p> <blockquote> <p><a title="doi" href="https://doi.org/10.1107/S205979832500511X" target="_blank" rel="noopener"><code><em>Efficient high-resolution refinement in cryo-EM with stochastic gradient descent</em>.</code></a></p> <p><em>Bogdan Toader, Marcus A. Brubaker, Roy R. Lederman</em></p> <pre>Acta Crystallographica Section D, 2025</pre> </blockquote> <p>The outputs are obtained by running the Jupyter notebooks in the <em>notebooks/preconditioned_sgd</em> directory in the GitHub repository (release v0.2):</p> <blockquote> <p><a title="github link" href="https://github.com/bogdantoader/simplecryoem">https://github.com/bogdantoader/simplecryoem</a></p> </blockquote> <div>The particle images used for these experiments can be downloaded from <a title="empiar-10076 link" href="https://www.ebi.ac.uk/empiar/EMPIAR-10076">EMPIAR-10076</a> and require inverting the contrast. The file containing the pose variables and CTF parameters is the <em>particles_file/my_particles_8.star </em>file in the attached archive.</div>
Cryo-4D-STEM datasets on cells and cellular organelles for demonstrating a dose-Efficient cryo-EM technique: tilt-Corrected Scanning Transmission Electron Microscopy
<p>This upload contains three 4D-STEM datasets in .raw format for demonstrating a dose-efficient cryo-EM technique for thick samples: tilt-corrected Scanning Transmission Electron Microscopy (tcBF-STEM). The dataset dimension is 128130256*256. Data were acquired on vitrified intact E.coli cells and isolated human cell organelles. This upload also contains the EFTEM images in .mrc acqired in the same ROI as the 4D-STEM dataset. </p> <p>It also contains analysis of the manuscript's Fig 3 and Ext. data fig 8. </p>
Figura1 in OCORRÊNCIA DE CIGARRAS EM CAFÉ ARÁBICA NA REGIÃO DE MONTANHA DO ESTADO DO ESPIRITO SANTO1
Figura1: Representação esquemática da ocorrência das cigarras do cafeeiro, em café arábica, no estado do Espírito Santo.
Figura 1 in Diversidade de cigarras (Hemiptera-Homoptera) em ambientes florestais no município de Cotriguaçu, estado de Mato Grosso
Figura 1 - Estudo de similaridade entre diferentes ambientes florestais amostrados no município de Cotriguaçu, MT, período de agosto de 2007 a julho de 2008.
Figura 2 in Cigarras (Cicadidae) coletadas por armadilha luminosa em mata da galeria no município de Israelândia, Goiás
Figura 2. Sazonalidade de espécies de cigarras coletadas por armadilha luminosa em área de mata de galeria no município de Israelândia, GO, entre setembro de 2016 e junho de 2017.
ScienceDex guides
Understand access before you commit
These curated guides explain access requirements, typical timelines, costs, and reuse considerations for widely used research datasets.
Allen Brain Atlas
Allen Brain Atlas is an Allen Institute collection of brain map atlases, datasets, APIs, and analysis tools covering mouse, human, and non-human primate brain resources.
Annotated Behaviour and Observability Dataset (ABODe)
ABODe is a University of Edinburgh DataShare dataset for behavior classification in group-housed mice using home-cage video, identities, bounding boxes, ground-plate positions, and annotator labels.
DANDI Archive for NWB datasets
DANDI is a BRAIN Initiative archive for publishing and sharing neurophysiology data, including electrophysiology, optophysiology, and behavioral data packaged as NWB and related standards.
International Brain Laboratory public data
The International Brain Laboratory public data releases expose standardized mouse decision-making experiments, including Neuropixels recordings, widefield calcium imaging, behavior, and session metadata accessed through the ONE API.
OpenNeuro
OpenNeuro is a free, open platform for sharing neuroimaging datasets, with public search, dataset pages, and download paths for web, S3, DataLad, and the OpenNeuro CLI.